风疹病毒JR23株包膜糖蛋白E2的遗传与变异分析
参见附件(91kb)。
王志玉;王小凡;王战勇;薛永磊;宋艳艳 山东大学公共卫生学院病毒学研究室 济南250012 病毒学报 2003 2
关键词:风疹病毒;E2基因;同源性
为了探讨风疹病毒(rubellavirus,RV)包膜糖蛋白E2的基因与蛋白的遗传与变异特点,利用DNAstar软件比较JR23株与GenBank中各参考株E2的基因与多肽序列,分析不同RV株E2基因之间的同源性及E2蛋白功能关键区的氨基酸变异。结果表明,RVE2基因序列比较保守,但JR23株E2基因序列与其它9个分离株之间有明显差异,变异主要集中在484nt~554nt。同源性为90 3%~92 6%之间,与美国疫苗株RA27/3同源性最高,与美国疫苗株HPV77同源性最低,GenBank中的参考株间同源性较高,在96 3%~100 0%之间。E2多肽变异集中于161aa~185aa,但在E2功能关键区,如N端序列、N联糖基化位点、...
关键词:风疹病毒;E2基因;同源性
为了探讨风疹病毒(rubellavirus,RV)包膜糖蛋白E2的基因与蛋白的遗传与变异特点,利用DNAstar软件比较JR23株与GenBank中各参考株E2的基因与多肽序列,分析不同RV株E2基因之间的同源性及E2蛋白功能关键区的氨基酸变异。结果表明,RVE2基因序列比较保守,但JR23株E2基因序列与其它9个分离株之间有明显差异,变异主要集中在484nt~554nt。同源性为90 3%~92 6%之间,与美国疫苗株RA27/3同源性最高,与美国疫苗株HPV77同源性最低,GenBank中的参考株间同源性较高,在96 3%~100 0%之间。E2多肽变异集中于161aa~185aa,但在E2功能关键区,如N端序列、N联糖基化位点、...
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