分子免疫佐剂就是可在体内表达各种免疫相关分子的重组质粒DNA和本身就具有免疫刺激效应的DNA(即CpG DNA)，这些免疫相关分子包括细胞因子、免疫共刺激分子、免疫刺激调节分子及其新型分子佐剂补体C3d等。

    1 细胞因子

    细胞因子是体内免疫细胞或非免疫细胞产生的一组具有广泛生物活性的异质性肽类调节因子，在体内能激活和调节免疫活性细胞，对免疫应答的产生和调节具有重要作用。因此，早在DNA疫苗产生以前就有人把细胞因子作为佐剂与疫苗联用，但由于细胞因子在体内半衰期太短且造价昂贵，未能在传统疫苗中广泛应用。受DNA疫苗以质粒作为抗原载体的启发，以重组质粒表达的细胞因子克服了原有的弱点在DNA疫苗这个领域中获得了更多的重视和研究;其中，以对IL-2、IL-12和GM-CSF的研究最为活跃。

    1.1 IL-2 IL-2可作用于多种细胞，包括T、B淋巴细胞、巨噬细胞和NK细胞等，对免疫应答具有广泛的上调作用。1994年，Chow等 [1] 将IL-2应用于HBV-DNA疫苗的研究中。他们分别构建了表达HBV中蛋白(S 2 -S)、IL-2、S 2 -S-IL-2融合蛋白的质粒:pS 2 -S、pIL-2、pS 2 -S-IL-2。结果显示:给小鼠肌肉注射1μg的pS 2 -S/pIL-2或pS 2 -S-IL-2，得到的抗体滴度和CD4 + T细胞增殖均相当于单独注射100μg的pS 2 -S。当注射等量的各质粒时，体外检测脾细胞分泌的各种细胞因子量，发现IL-2大幅度地加强了IFN-γ、IL-2的分泌，而对IL-4只有轻微的加强，说明IL-2主要是加强了机体的T H 1型免疫应答。同时还发现IL-2有助于打破免疫耐受，当给B10.M耐受型小鼠注射等量的上述各质粒及HBV重组蛋白抗原后，pS 2 -S/pIL-2组和pS 2 -S-IL-2组的抗体滴度比pS 2 -S组高的多，而重组蛋白抗原组则几乎测不到抗体。Barouch等 [2] 的研究结果却提示:单独表达IL-2的质粒不能增强HIV gp120DNA疫苗诱发的免疫应答，只有表达IL-2/Ig融合蛋白的质粒才能明显地增强特异性抗体的产生和T细胞增殖，而且这种增强效应必须在注射gp1202天或5天后再注射IL-2/Ig表达质粒才有效;如果同时或提前注射则没有任何效应，甚至产生下调效应。Barouch等认为与上述Chow的研究结果相去甚远的主要原因是所选用的抗原不同所致，尤其表现在gp120蛋白本身就是一级强的抗原，提示同一细胞因子对编码不同抗原的DNA疫苗的反应不尽相同 ......