转基因烟草荧光定量检测方法研究.pdf
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2006年2月23日
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中国生物工程杂志 C h i n a B i o t e c h n o l o g y , 2 0 0 5 , 2 5 ( 1 ) : 7 6 ~8 0
转基因烟草荧光定量检测方法研究
郭兆 奎 ” 颜 培强
( 1黑龙江烟草科学研究所 牡丹江 1 5 7 0 1 1
万 秀清 李丽 杰 杨 谦
2哈尔滨工业大学生命科学院 哈尔滨 1 5 0 0 0 1 )
摘要 依据实时定量P C R原理, 参照3 5 S启动子、 N O S终止子、 G U S 基因和N t r F I I 基因序列设计
T a q Ma n引物和荧光标记探针。采用美国 Ⅲ 公司O p t i c o n T M 2 荧光定量 P C R检测 系统对烤后烟叶
进行转基因定量检测技术研究, 从中筛选出扩增效率高, 灵敏度好的 P C R引物和探针序列, 同时
通过对扩增体 系, 扩增条件的梯度实验, 优化 出荧光定量检测的最佳反应体系和反应条件, 从而
建立了转基因烟草定量检测方法 该方法经验证其检测灵敏度达到0 . 0 5 %。在 2 0 0 3年 6月参
加 C O R E S T A ( 国际烟草科研与合作中心) 组织的国际烟草转基 因定量检测合作试验中, 该优化转
基因烟草定量检测技术获得 了较好成绩, 对盲检样品检测结果评价( Z 。 s c o r e ) 列国际 1 2家实验室
之首, 证明此法灵敏度高、 稳定性好。
关键词 烟草 转基因检测 荧光定量 P C R
由于转基因作物的安全性研究尚未取得突破性
进展, 还没有足够证据证明转基因产品对环境和对
人体健康是否具有危害, 消费者还不能完全接受转
基因制品, 各国政府相继出台了转基因制品管理条
例, 转基因检测已成为市场准入的重要检测指标。
作为基因工程研究的模式植物, 烟草是进行转
基因研究最早, 也是转基因种类较多的经济作物, 自
1 9 ~ o 6年以来, 已经将烟草花叶病毒 ( Ⅳ) , 马铃薯Y
病毒( P V y) , 马铃薯 x病毒( P v x) , 黄瓜花叶病毒
( C M V ) , 苜蓿花叶病毒( 州 ) , 烟草脆裂病毒( T R v)
的外壳蛋白基因, 马铃薯Y病毒复制酶基因、 黄瓜花
叶病毒的微卫星 R N A, 几丁质酶基因、 抗菌肽基因、葡萄糖氧化酶、 苏云金芽孢杆菌杀虫蛋白基因( 盯)
和蛋白酶抑制剂基因…等上百种外源基因转入烟草
获得表达, 致使转基因烟草目的基因种类较为复杂,同时由于烤烟必须经过长达6天的高温( 约7 0 o C ) 烘
烤调制过程, D N A降解严重, 给转基因检测技术提出
了更高的要求, 郭等 优化了适于烤后烟叶 D N A提
取方法并提出了转基因烟草检测方法, 他们 利
用竞争性 P C R原理提出了转基因烟草半定量检测方
法, 为进一步提高检测灵敏度, 杜绝操作中可能出现
收稿日期 : 2 0 0 4 - 0 9 - 2 0 修回日期 : 2 O O 4 — 1 0 - 2 6
国家烟草专卖局资助项 目( 1 1 0 2 0 0 1 0 1 0 0 8 )
电子信箱: G - -Z K@s o h u . c 0 I n
的污染的影响, 我们引入了内标准荧光定量 P C R技
术 , 通过靶序列和内标序列T a q Ma n 引物、 探针设
计和反应体系、 条件优化, 进行转基因烟草定量检测
技术的试验研究。
1 材 料
1 . 1 材 料
标准样品含有 0 . 1 %, 0 . 5 %, 1 %, 2 %, 5 %, 0 %
转基 因成分 ( 由英 国政府化学家实验室 I _ F A 3提
供) , 待测样品 A、 B 、 C 、 D、 E、 F 、 G由本实验室 自行
配制含量分别为 0 . 4 o %、 1 . 1 0 %、 0 . 6 0 %、 0 . 1 0 %、2 . 0 o %、 0 . 5 0 %、 0 . 2 0 %, H为阴性对照。
1 . 2 试 剂
实时定量 P C R检测试剂购 自美 国 A B I 公司,其它主要化学试剂为美国 P r o m e g a 、 S i g m a 公司或国
产 A R级试剂。荧光定量 P C R引物和探针由大连
宝T a K a R a 生物公司合成。
1 . 3 仪 器
采用美国 Ⅲ 公司 O p t i c o n T M 2实时荧光基因检
测系统
2 方 法
2 . 1 样品 D N A提取与浓度、 纯度测定
称 3 0 0 m g烟草干粉样品加入 1 . 5 m l 离心管中,维普资讯 http:www.cqvip.com 郭兆奎 等 : 转基因烟草荧光定量检测方法研究 7 7
加 7 0 0 t t l 2倍 C T A B ( 2 % C T A B ; 2 0 % 0 . 5 m o l L T r i s ;
4 % 0 . 5 m o l L E D T A; 8 . 1 8 % N a C l ; 1 % P V P ) 抽提缓
冲液, 振荡混 匀后, 6 5 ℃的恒 温水 浴 1 0 m i n 。加
7 0 0 t t l 氯仿 异戊醇 ( 2 4: 1 , v v ) , 混匀 1 2 0 0 0 g离心
5 m i n 。取上清液 , 加 1 1 0体积的 1 0 % C T A B提取缓
冲液 , 加入等体积的氯仿 异戊醇( 2 4: 1 , v v ) 混匀后
在 1 2 0 0 0 g 离心 5 m i n 。取上清, 加等体积的 C T A B沉
淀缓冲液( 1 % C T A B ; 1 %0 . 5 m o l L T r i s ; 2 %0 . 5 m o l
L E D T A ) , 混匀后在 1 5 0 0 0 g离心 8 mi n去上清, 加
i 0 0 t ~高盐 , I E缓 冲液 ( 2 % 0 . 5 m o l L T r i s ; 0 . 2 %
E 叽 ; 5 . 8 4 4 % N a C 1 ) , 6 5 o C水浴 1 0 m i n加入二倍体
积冷无水乙醇, 于 一4 0 ℃冷置 3 0 m i n 。1 5 0 0 0 g离心
8 m i n , 沉淀溶于 5 0 0 t ~超纯水, 通过紫外分光光度计
2 6 0 n m和2 6 0 n m 2 8 0 n m估算 D N A提取物的浓度和
纯度。
2 . 2 荧光定量 P C R引物和探针设计
根据 花 椰 菜 花 叶 病 毒 3 5 S启 动 子 ( :
2 1 7 3 3 9 6 ) , 根癌农杆菌 n o s终止 子 ( g i : 3 3 1 9 8 6 1 ) 、G U S 报告基因( : 4 7 5 1 6 9 ) 和卡那霉素抗性基因
( N P T I I ) 序列( g i : 1 9 5 6 9 2 3 0 ) J , 设计合成 4种荧光
P C R反应扩增引物和荧光标记探针进行烟草转基
因定量检测的引物优化 , 为消除 P C R反应管中模
板量差异而引起的荧光信号的误差, 试验中以烟草
内源基因烟草硝酸还原酶基因 N R( : 1 9 8 9 4 ) 设计
引物和探针作为内标加入同一反应管中, 应用 I Ⅵ J
公司o p t i c 0 n 2 荧光定量 P C R实时检测外源序列和
内源序列的荧光信号( 表 1 ) ......
转基因烟草荧光定量检测方法研究
郭兆 奎 ” 颜 培强
( 1黑龙江烟草科学研究所 牡丹江 1 5 7 0 1 1
万 秀清 李丽 杰 杨 谦
2哈尔滨工业大学生命科学院 哈尔滨 1 5 0 0 0 1 )
摘要 依据实时定量P C R原理, 参照3 5 S启动子、 N O S终止子、 G U S 基因和N t r F I I 基因序列设计
T a q Ma n引物和荧光标记探针。采用美国 Ⅲ 公司O p t i c o n T M 2 荧光定量 P C R检测 系统对烤后烟叶
进行转基因定量检测技术研究, 从中筛选出扩增效率高, 灵敏度好的 P C R引物和探针序列, 同时
通过对扩增体 系, 扩增条件的梯度实验, 优化 出荧光定量检测的最佳反应体系和反应条件, 从而
建立了转基因烟草定量检测方法 该方法经验证其检测灵敏度达到0 . 0 5 %。在 2 0 0 3年 6月参
加 C O R E S T A ( 国际烟草科研与合作中心) 组织的国际烟草转基 因定量检测合作试验中, 该优化转
基因烟草定量检测技术获得 了较好成绩, 对盲检样品检测结果评价( Z 。 s c o r e ) 列国际 1 2家实验室
之首, 证明此法灵敏度高、 稳定性好。
关键词 烟草 转基因检测 荧光定量 P C R
由于转基因作物的安全性研究尚未取得突破性
进展, 还没有足够证据证明转基因产品对环境和对
人体健康是否具有危害, 消费者还不能完全接受转
基因制品, 各国政府相继出台了转基因制品管理条
例, 转基因检测已成为市场准入的重要检测指标。
作为基因工程研究的模式植物, 烟草是进行转
基因研究最早, 也是转基因种类较多的经济作物, 自
1 9 ~ o 6年以来, 已经将烟草花叶病毒 ( Ⅳ) , 马铃薯Y
病毒( P V y) , 马铃薯 x病毒( P v x) , 黄瓜花叶病毒
( C M V ) , 苜蓿花叶病毒( 州 ) , 烟草脆裂病毒( T R v)
的外壳蛋白基因, 马铃薯Y病毒复制酶基因、 黄瓜花
叶病毒的微卫星 R N A, 几丁质酶基因、 抗菌肽基因、葡萄糖氧化酶、 苏云金芽孢杆菌杀虫蛋白基因( 盯)
和蛋白酶抑制剂基因…等上百种外源基因转入烟草
获得表达, 致使转基因烟草目的基因种类较为复杂,同时由于烤烟必须经过长达6天的高温( 约7 0 o C ) 烘
烤调制过程, D N A降解严重, 给转基因检测技术提出
了更高的要求, 郭等 优化了适于烤后烟叶 D N A提
取方法并提出了转基因烟草检测方法, 他们 利
用竞争性 P C R原理提出了转基因烟草半定量检测方
法, 为进一步提高检测灵敏度, 杜绝操作中可能出现
收稿日期 : 2 0 0 4 - 0 9 - 2 0 修回日期 : 2 O O 4 — 1 0 - 2 6
国家烟草专卖局资助项 目( 1 1 0 2 0 0 1 0 1 0 0 8 )
电子信箱: G - -Z K@s o h u . c 0 I n
的污染的影响, 我们引入了内标准荧光定量 P C R技
术 , 通过靶序列和内标序列T a q Ma n 引物、 探针设
计和反应体系、 条件优化, 进行转基因烟草定量检测
技术的试验研究。
1 材 料
1 . 1 材 料
标准样品含有 0 . 1 %, 0 . 5 %, 1 %, 2 %, 5 %, 0 %
转基 因成分 ( 由英 国政府化学家实验室 I _ F A 3提
供) , 待测样品 A、 B 、 C 、 D、 E、 F 、 G由本实验室 自行
配制含量分别为 0 . 4 o %、 1 . 1 0 %、 0 . 6 0 %、 0 . 1 0 %、2 . 0 o %、 0 . 5 0 %、 0 . 2 0 %, H为阴性对照。
1 . 2 试 剂
实时定量 P C R检测试剂购 自美 国 A B I 公司,其它主要化学试剂为美国 P r o m e g a 、 S i g m a 公司或国
产 A R级试剂。荧光定量 P C R引物和探针由大连
宝T a K a R a 生物公司合成。
1 . 3 仪 器
采用美国 Ⅲ 公司 O p t i c o n T M 2实时荧光基因检
测系统
2 方 法
2 . 1 样品 D N A提取与浓度、 纯度测定
称 3 0 0 m g烟草干粉样品加入 1 . 5 m l 离心管中,维普资讯 http:www.cqvip.com 郭兆奎 等 : 转基因烟草荧光定量检测方法研究 7 7
加 7 0 0 t t l 2倍 C T A B ( 2 % C T A B ; 2 0 % 0 . 5 m o l L T r i s ;
4 % 0 . 5 m o l L E D T A; 8 . 1 8 % N a C l ; 1 % P V P ) 抽提缓
冲液, 振荡混 匀后, 6 5 ℃的恒 温水 浴 1 0 m i n 。加
7 0 0 t t l 氯仿 异戊醇 ( 2 4: 1 , v v ) , 混匀 1 2 0 0 0 g离心
5 m i n 。取上清液 , 加 1 1 0体积的 1 0 % C T A B提取缓
冲液 , 加入等体积的氯仿 异戊醇( 2 4: 1 , v v ) 混匀后
在 1 2 0 0 0 g 离心 5 m i n 。取上清, 加等体积的 C T A B沉
淀缓冲液( 1 % C T A B ; 1 %0 . 5 m o l L T r i s ; 2 %0 . 5 m o l
L E D T A ) , 混匀后在 1 5 0 0 0 g离心 8 mi n去上清, 加
i 0 0 t ~高盐 , I E缓 冲液 ( 2 % 0 . 5 m o l L T r i s ; 0 . 2 %
E 叽 ; 5 . 8 4 4 % N a C 1 ) , 6 5 o C水浴 1 0 m i n加入二倍体
积冷无水乙醇, 于 一4 0 ℃冷置 3 0 m i n 。1 5 0 0 0 g离心
8 m i n , 沉淀溶于 5 0 0 t ~超纯水, 通过紫外分光光度计
2 6 0 n m和2 6 0 n m 2 8 0 n m估算 D N A提取物的浓度和
纯度。
2 . 2 荧光定量 P C R引物和探针设计
根据 花 椰 菜 花 叶 病 毒 3 5 S启 动 子 ( :
2 1 7 3 3 9 6 ) , 根癌农杆菌 n o s终止 子 ( g i : 3 3 1 9 8 6 1 ) 、G U S 报告基因( : 4 7 5 1 6 9 ) 和卡那霉素抗性基因
( N P T I I ) 序列( g i : 1 9 5 6 9 2 3 0 ) J , 设计合成 4种荧光
P C R反应扩增引物和荧光标记探针进行烟草转基
因定量检测的引物优化 , 为消除 P C R反应管中模
板量差异而引起的荧光信号的误差, 试验中以烟草
内源基因烟草硝酸还原酶基因 N R( : 1 9 8 9 4 ) 设计
引物和探针作为内标加入同一反应管中, 应用 I Ⅵ J
公司o p t i c 0 n 2 荧光定量 P C R实时检测外源序列和
内源序列的荧光信号( 表 1 ) ......
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