[摘要]目的: 研究利用乙型肝炎病毒X基因区序列构建系统发育树进行基因型分析的可靠性。 方法: 从美国NCBI基因库中下载HBV全基因序列共249条，其中166条为已知基因型的序列，83条为未知型序列。利用ClustalX1.8软件和TreeView软件对已知基因型的X区序列构建进化树图，分析由该方法获得的基因型是否与原来的吻合，并对未知型序列进行基因型分析，再用S区的进化树分析加以验证。 结果: 已明确基因型的166条序列利用X基因区序列分析得到的基因型与原先的基因型完全吻合。用X区和S区序列分析方法对83条未知型序列分析的结果是一致的，分别获得A型16条、B型17条、C型27条、D型21条及F型2条，未发现E、G和H型。 结论: 利用乙型肝炎病毒X基因区序列进行基因型分析是完全可靠的，有助于HBV的致病机制研究。

    [关键词] 乙型肝炎病毒;基因型;系统发育树;X基因

    乙型肝炎病毒(HBV)属于嗜肝DNA病毒科，具有双链DNA分子结构，全长大约3.2kb。由于HBV以mRNA为中间体进行逆转录复制，复制过程缺乏校对酶的作用容易发生碱基配对错误，导致HBV基因突变十分频繁。虽然HBV的血清型分型已建立多年，但不能深刻反映HBV病毒的变异，其临床上意义也不大。HBV基因型分型方法以HBV全基因序列核苷酸异源性≥8%为不同基因型的分型标准[1] ，至今已发现A～H8种基因型。HBV的X基因在致肝病过程中起着至关重要的作用，它与肝癌的发生有着密切的联系。目前还没有利用X基因序列对HBV进行基因型分型的相关报道，作者利用NCBI基因库中的资源，对用X基因序列进行HBV基因分型作一研究。

     1 材料与方法

    1.1 HBV基因序列的来源

    利用互联网络从美国NCBI基因库(http:..www.ncbi.nlm.nih.gov)中下载HBV全基因序列249条 ......