http://www.100md.com
罗皓,梁浩，邵一鸣，张志勇，邢辉,刘伟，卢灿健，沈菁
人类免疫缺陷病毒1型；基因型；聚合酶链反应,,人类免疫缺陷病毒1型；基因型；聚合酶链反应,1材料与方法,2结果,3讨论,参考文献
摘要： 目的 建立一种简便、快速基因分型方法，对广西人类免疫缺陷病毒(HIV-1)重组毒株gag基因区进行亚型鉴定。方法 从HIV阳性样本中提取核酸，使用HIV-1 M组通用引物对gag区进行第1轮扩增，第2轮使用分别检测C亚型和CRF01-AE重组型的二套特异性引物放入同一反应管中进行扩增，根据不同亚型扩增的目的带位置不同判断亚型。另外设计了一套引物，专门用于检测B'/C重组毒株。扩增出的所有样本均进行基因测序和系统树分析以验证结果。结果 54份样本中，经基因测序和系统树分析证实CRF08-BC样本4份(741%), CRF01-AE样本46份(8518%), 4份(741)无法确定亚型。经亚型特异性引物PCR法检测出4份(100%) B'/C重组毒株，45份(9783%) CRF01-AE重组毒株，灵敏度为98%，特异性为100%。2种方法检测结果经差异性检验显示，P>005，差异无统计学意义，结果一致性高达9815%。与基因分析结果吻合。重复实验显示，B'/C的平均重复性为100% (20/20),CRF01-AE为983% (59/60)。结论 该方法具有简便、快速，高度灵敏度和特异性的特点，可直接对广西HIV -1重组毒株CRFO 1-AE gag基因区进行分型 ......