新研究成果改变现有观念 人类基因组是个复杂网络
由英国、美国等多个国家组织的ENCODE研究组日前研究发现,人类基因组并非如传统观念所认为的由一系列整齐的独立基因组成,而是一个复杂的网络,包括基因、基因调控元件和其他类型的非编码DNA序列,以及他们之间的相互作用。(Nature 2007,447:799)
该研究小组在研究前期寻找出了基因组中有功能的元件,包括编码蛋白质的基因、非编码基因、调控基因转录的元件,以及保持染色体结构和介导复制的元件。ENCODE研究者随后重点研究了44个目标元件,总共约占人类基因组序列的1%,大约包含3000万对DNA碱基对。
结果显示,人类基因组的大部分DNA序列都被转录为RNA,包括非编码基因,并且这些转录片段大量重叠。这与传统观念中“基因分散、被无意义的DNA序列隔开”不符。研究者还发现,基因组很少包含无意义序列,所有的基因组成了一个复杂的网络。另外,以前认为,有重要生物学功能的DNA序列在进化上都是高度保守的。而该研究证实,约半数的有功能元件在进化上并不保守。其他发现还包括,对转录调控的系统检查发现了很多以前未识别的转录起始位点,转录调控序列可以存在于转录起始位点下游或上游,找出了组蛋白变化的特异标志,对DNA复制和组蛋白改变的机制有了更深入的了解等。
研究者认为,这些发现中很多与人们现有的观念不同,这些发现对进一步认识人类基因组功能有重要意义。
相关链接
ENCODE研究小组成员来自澳大利亚、奥地利、加拿大、德国、日本、新加坡、西班牙、瑞典、瑞士、英国和美国的学术、政府和工业组织。参照人类基因组项目中的模式,该研究项目的成果和数据都存放在公共数据库中(www.genome.ucsc.edu/ENCODE)。, http://www.100md.com
该研究小组在研究前期寻找出了基因组中有功能的元件,包括编码蛋白质的基因、非编码基因、调控基因转录的元件,以及保持染色体结构和介导复制的元件。ENCODE研究者随后重点研究了44个目标元件,总共约占人类基因组序列的1%,大约包含3000万对DNA碱基对。
结果显示,人类基因组的大部分DNA序列都被转录为RNA,包括非编码基因,并且这些转录片段大量重叠。这与传统观念中“基因分散、被无意义的DNA序列隔开”不符。研究者还发现,基因组很少包含无意义序列,所有的基因组成了一个复杂的网络。另外,以前认为,有重要生物学功能的DNA序列在进化上都是高度保守的。而该研究证实,约半数的有功能元件在进化上并不保守。其他发现还包括,对转录调控的系统检查发现了很多以前未识别的转录起始位点,转录调控序列可以存在于转录起始位点下游或上游,找出了组蛋白变化的特异标志,对DNA复制和组蛋白改变的机制有了更深入的了解等。
研究者认为,这些发现中很多与人们现有的观念不同,这些发现对进一步认识人类基因组功能有重要意义。
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ENCODE研究小组成员来自澳大利亚、奥地利、加拿大、德国、日本、新加坡、西班牙、瑞典、瑞士、英国和美国的学术、政府和工业组织。参照人类基因组项目中的模式,该研究项目的成果和数据都存放在公共数据库中(www.genome.ucsc.edu/ENCODE)。, http://www.100md.com