利用重定位策略从中药中发现L—型钙离子通道作用降压药(3)
1.2.5 TCMD搜索 按照Drugbank的搜索方法，对TCMD中收录的23 033种中药化合物进行同样的搜索，对搜索结果进行分析，对排名靠前的并且和模型匹配较好的中药有效成分进行文献验证，评价其降压作用。
2 结果与讨论
2.1 HipHop药效团模型
计算得到10个HipHop药效团模型，且均含有6个药效特征，为HHHHAA，10个药效团的模型的输出及测试集数据库搜索，结果见表1。由表1可知，CAI最高的4号药效团模型具有6个药效特征，分别是4个疏水基团(H)和2个氢键受体，是HipHop算法得到的最优药效团模型，见图2。
本文所得的10个药效团模型CAI均大于2，活性化合物有效命中率较高，但命中活性化合物的同时亦有较多非活性化合物被命中，考虑到其模型预测结果存在一定假阳性。在后期实际应用中，通过减小模型的R值来提高活性化合物命中率，降低非活性化合物命中率。
2.2 Drugbank数据库搜索结果
利用最优药效团模型筛选Drugbank数据库，共命中249个化合物，涉及已上市药物93个。目前，Drugbank数据库共收录13种已上市钙通道拮抗剂，通过药效团检索，命中其中10种，且与模型匹配程度较好，表明药效团模型具有一定的数据库搜索能力。同时，保留匹配结果较好的前40个已上市药物，其中部分化合物 ......
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2 结果与讨论
2.1 HipHop药效团模型
计算得到10个HipHop药效团模型，且均含有6个药效特征，为HHHHAA，10个药效团的模型的输出及测试集数据库搜索，结果见表1。由表1可知，CAI最高的4号药效团模型具有6个药效特征，分别是4个疏水基团(H)和2个氢键受体，是HipHop算法得到的最优药效团模型，见图2。
本文所得的10个药效团模型CAI均大于2，活性化合物有效命中率较高，但命中活性化合物的同时亦有较多非活性化合物被命中，考虑到其模型预测结果存在一定假阳性。在后期实际应用中，通过减小模型的R值来提高活性化合物命中率，降低非活性化合物命中率。
2.2 Drugbank数据库搜索结果
利用最优药效团模型筛选Drugbank数据库，共命中249个化合物，涉及已上市药物93个。目前，Drugbank数据库共收录13种已上市钙通道拮抗剂，通过药效团检索，命中其中10种，且与模型匹配程度较好，表明药效团模型具有一定的数据库搜索能力。同时，保留匹配结果较好的前40个已上市药物，其中部分化合物 ......
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