基于“中药作用机理辅助解析系统”的金钗石斛降糖作用机制研究(2)

http://www.100md.com 2015年10月1日 中国中药杂志2015年第19期

     因此，本研究采用实体语法系统推理规则构建金钗石斛化学成分靶点疾病关系网络。本研究构建金钗石斛化学成分作用靶点与2型糖尿病靶点关系的实体语法系统模型，V主要包含组成金钗石斛作用生物网络的节点类型，F包括网络中节点关系类型以及为后续推断过程所准备的虚拟实体类型，P所包含的规则用于金钗石斛作用靶点与2型糖尿病靶点关系的推断。药物靶点与疾病相关蛋白的相互作用关系包括作用方向、作用方式、作用距离三要素。具体推理规则详见文献[7]。

    1.3金钗石斛化学成分糖尿病靶点关系网络的可视化软件Cytoscape_v321 (http：//wwwcytoscapeorg/)是一个用于可视化分子相互作用网络的开源软件平台。因此，利用Cystocape321将金钗石斛与2型糖尿病相互作用的生物网络可视化。这个网络通过连接金钗石斛的化学成分与2型糖尿病的相关靶点建立。

    2结果与讨论

    2.1金钗石斛化学成分作用靶点辨识结果利用实体语法系统，对目前已报道的金钗石斛中所有化学成分及2型糖尿病相关靶点间的关系进行推理。能作用于2型糖尿病相关靶点的化学成分有21个，见图1；涉及到的疾病靶点有11个 ......