重组乙肝疫苗免疫后保护效果良好。新生儿在接种国产重组乙肝疫苗后免疫效果良好。但目前重组乙肝疫苗存在着一些问题：约有10%～15%的人不产生保护性抗体或抗体水平很低；容易造成漏种；基因变异株有可能在免疫后人群中流行而成为新的公共卫生问题。实验证明：基因重组乙肝疫苗无或低应答与HLA-DRBl*07基因密切相关；而HLA-DRBl*13对乙肝疫苗的免疫应答无明显影响。含其它蛋白序列的重组乙肝疫苗主要是含有乙肝病毒preS2和preSl抗原成分或HBV S基因变异株核心蛋白成分的各种新型重组乙肝疫苗，具有更大的免疫原性，能诱导更高效的免疫应答和抗体产生，中和乙肝病毒，保护机体免受病毒攻击，并可打破免疫耐受，清除乙肝病毒。新构建的重组疫苗病毒系统对HBV的感染能引起较宽的抗体反应，可望成为一种新型的重组疫苗。

    2.4 合成肽疫苗

    合成肽疫苗是一种仅含免疫决定簇组分的小肽, 即用人工方法按天然蛋白质的氨基酸顺序合成保护性短肽, 与载体连接后加佐剂所制成的疫苗。

    HIV的多肽疫苗刺激中和抗体和细胞免疫能力很差，其刺激机体产生的抗体通常不能中和感染者自身携带的病毒，基本不能诱导细胞免疫，但多肽、融合蛋白和长脂肽的多表位联合疫苗既能单独使用，又能在初免-加强策略中与重组活载体疫苗联合使用。HIV的合成肽疫苗工艺简单，无安全性顾虑，但人体免疫原性较弱，合成昂贵。乙肝的合成肽疫苗安全性与稳定性较好，不仅能诱发体液免疫和细胞免疫，清除细胞内感染的乙肝病毒，还可使基因工程疫苗免疫无应答者产生抗体 ......