Jurkat T细胞质膜蛋白组学研究初探
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甘成军 谭江琳 胡婕 王晓娟 张翠华 张晓容 罗高兴 贺伟峰 吴军 第三军医大学西南医院烧伤研究所&烧伤、创伤、复合伤国家重点实验室疾病蛋白质组学重庆市市级重点实验室;
【摘要】目的:分析Jurkat T细胞质膜蛋白质组成,并对这些质膜蛋白的生理学过程和功能进行初步分析,为进一步研究Jurkat T细胞膜蛋白功能奠定基础。方法:首先采用差异密度梯度离心法提取Jurkat T细胞膜蛋白,然后将提取出的膜蛋白根据分子量大小通过SDS-PAGE进行初步分离,再进一步将分离出的蛋白条带切下进行胶内酶解,酶解后的肽段通过液相-芯片-离子阱质谱技术进行鉴定和生物信息学分析,建立Jurkat T细胞质膜蛋白全谱图,并进一步通过GO(Gene Ontology)对这些质膜蛋白进行功能分析。结果:成功提取了Jurkat T细胞的膜总蛋白,并建立了Jurkat T细胞质膜蛋白全谱图,共鉴定出618个质膜蛋白,经GO注释分析,其中与结合功能相关的质膜蛋白有493个,与信号转导活性相关的有186个,具有酶催化活性的有166个,具有转运活性的有137个,有些还具有酶调节活性、结构分子活性或者运动活性等,功能尚不清楚的有49个。结论:通过差异密度梯度离心,结合一维SDS-PAGE和HPLC-CHIP-MS/MS,成功建立了Jurkat T细胞质膜蛋白全谱图,并通过GO注释,初步分析了这些蛋白的功能和生理学过程,为进一步研究Jurkat T细胞质膜蛋白的功能奠定了基础。
【关键词】 质膜蛋白质组 Jurkat T细胞 HPLC-CHIP-MS/MS
【基金】国家自然科学基金(30500477) 国家高技术研究发展计划(863计划)(No.2006AA02A121)。
【分类号】R392
前言JurkatT细胞是来源于T淋巴细胞和急性T细胞自血病的细胞株，在血液病研究、基础免疫研究以及药理学研究方面有着很重要的作用[‘一伙细胞质膜位于细胞和周围环境(临近的细胞、毛细血管活着细胞外基质等)的交界面〔细胞质膜蛋自在很多生物学功能例如细胞和细胞、细胞和基
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Jurkat T细胞是来源于T淋巴细胞和急性T细胞白血病的细胞株，在血液病研究、基础免疫研究以及药理学研究方面有着很重要的作用。细胞质膜位于细胞和周围环境(临近的细胞、毛细血管活着细胞外基质等)的交界面。细胞质膜蛋白在很多生物学功能例如细胞和细胞、细胞和基质的相互作用、离子以及其它分子的转运以及作为各种信号分子的受体调节信号的转导方面发挥着关键的作用。膜蛋白大约占人类整个基因组编码蛋白的1/3，但是却占已知的和正在开发的药物作用的蛋白靶点的2/3以上。因此研究质膜蛋白，对了解细胞的生物学过程以及发现新的药物作用靶点有着重要的意义。在本实验中我们采用差异密度梯度离心方法，提取Jurkat T细胞的膜蛋白，通过一维SDS-PAGE结合HPLC-chip-MS/MS质谱鉴定以及生物信息学分析，建立了Jurkat T细胞质膜蛋白全谱图，共鉴定出618个质膜蛋白，并通过GO注释，对这些质膜蛋白的生理学过程和功能进行了初步的分析。
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