检测Snp的新技术：所见即所得
Biotechnology报道，可用显微镜直接观察DNA上的单碱基对的变化。
化学家Lieber和遗传学家Housman的梦幻组合创造了一项简单的新技术，应用原子压力显微镜(AFM)观察SNP。
首先设计一个寡核苷酸探针能与你要找的基因组区域严格匹配，将此探针与一大分子如链霉抗生物素偶联，让此探针与DNA片段进行杂交。如果探针杂交成功，那么用AFM进行观察就能发现杂交阳性位点。此方法比传统方法的一个明显优点是能够对单倍体基因组进行检测。当数个探针同时在数百Kb的距离上进行搜索，再加上自动分析，SNP的相关性研究恐怕能大大的向前迈进一步了。
Detection
of a streptavidin-labelled oligonucleotide on the M13mp18 plasmid (arrow). Scale bar, 200 nm. [Image courtesy of Adam T. Woolley and Charles M. Lieber, Harvard University]
相关文章：
Original research paper
Woolley, A. T., Guillemette, C., Cheung, C. L., Housman,D. E. & Lieber, C. M. Direct haplotyping of kilobase-size DNA using carbon nanotube probes. Nature Biotechnol. 18, 760–763 (2000).
Review
Brookes, A. J. The essence of SNPs. Gene 234, 177–186 (1999).
News and Views
Taton, T. A. & Mirkin, C. A. Haplotyping by force.
Nature Biotechnol. 18, 713 (2000). [Full text]
Lab pages
David E. Housman’s lab page at the Massachusetts
Institute of Technology (MIT).
The Lieber group homepage at Harvard.
Web sites
HGBASE – a database of all known sequence variations
in the human genome.
SNP database – a database of single nucleotide
polymorphisms.
新思路
新技术—其他文章, 百拇医药
化学家Lieber和遗传学家Housman的梦幻组合创造了一项简单的新技术，应用原子压力显微镜(AFM)观察SNP。
首先设计一个寡核苷酸探针能与你要找的基因组区域严格匹配，将此探针与一大分子如链霉抗生物素偶联，让此探针与DNA片段进行杂交。如果探针杂交成功，那么用AFM进行观察就能发现杂交阳性位点。此方法比传统方法的一个明显优点是能够对单倍体基因组进行检测。当数个探针同时在数百Kb的距离上进行搜索，再加上自动分析，SNP的相关性研究恐怕能大大的向前迈进一步了。
Detection
of a streptavidin-labelled oligonucleotide on the M13mp18 plasmid (arrow). Scale bar, 200 nm. [Image courtesy of Adam T. Woolley and Charles M. Lieber, Harvard University]
相关文章：
Original research paper
Woolley, A. T., Guillemette, C., Cheung, C. L., Housman,D. E. & Lieber, C. M. Direct haplotyping of kilobase-size DNA using carbon nanotube probes. Nature Biotechnol. 18, 760–763 (2000).
Review
Brookes, A. J. The essence of SNPs. Gene 234, 177–186 (1999).
News and Views
Taton, T. A. & Mirkin, C. A. Haplotyping by force.
Nature Biotechnol. 18, 713 (2000). [Full text]
Lab pages
David E. Housman’s lab page at the Massachusetts
Institute of Technology (MIT).
The Lieber group homepage at Harvard.
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HGBASE – a database of all known sequence variations
in the human genome.
SNP database – a database of single nucleotide
polymorphisms.
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