医学进展 HIV-1亚型多样性带来的挑战(1)
The Challenge of HIV-1 Subtype Diversity
Barbara S. Taylor M.D.等
美国纽约哥伦比亚大学医学中心内科和感染病专业
详情请见《中国医学论坛报》
综述
医学进展
HIV-1亚型多样性带来的挑战(图3，表2、3)
图3 在各亚型HIV-1中，蛋白酶多态性引起的主要氨基酸(AA)变化
将HIV-1蛋白酶的AA序列与B亚型的一致序列进行比较。使用斯坦福HIV耐药数据库(http://hivdb.stanford.edu/pages/algs/HIVseq.html)的HIVseq程序，获得多态性数据。如果数据库中某位点310%序列呈多态性，则显示某已知亚型HIV-1蛋白酶AA10~99的多态性。色柱内显示多态性序列的百分率。检索表中显示的是亚型的名称，后面圆括号中标注的是分析中得出的多态性序列数。黑色方块表示主要蛋白酶耐药突变位点，白色方块表示次要蛋白酶耐药突变位点，资料来源为2007年国际艾滋病学会美国分会发布的信息。左侧显示每个位点的主要AA变化。HIV-1逆转录酶AA40~240的多态性见补充附录，该附录与本文全文见www.nejm.org.
, http://www.100md.com
表2. 各亚型或流行重组型(CRF)的HIV-1流行特征*
亚型或CRF
地区
全球流行率
趋向性和复制
疾病进展
对治疗的反应
亚型
A
东非、中非、中亚及东欧
12.3%
多数利用CCR5，即便是在晚期感染40
, 百拇医药
NA
与C亚型和D亚型相比无显著差异41
B
美洲、西欧、东亚及大洋洲
10.2%
早期利用CCR5，而感染晚期利用CXCR4增加28
HLA-B7与CTL反应差和病毒血症增加相关42，43，HLA-B57与病毒感染进展慢相关42，巴西的B型病毒株与感染进展慢相关44
NA
C
印度、东非及南非
49.9%
, 百拇医药
绝大多数利用CCR5，即便是晚期感染28；感染者阴道排毒增加30，母婴传播率升高29，45
HLA-B57与病毒感染进展慢相关42
与A亚型和D亚型相比无显著差异46，但产生耐药的机制不同41,47-49
D
东非
2.5%
感染早期即使用CXCR427
在乌干达、肯尼亚和坦桑尼亚的患者中，疾病进展较A型快37-39
NA
G
, 百拇医药
西非
6.3%
NA
NA
NA
F、H、 J和K
各不相同
每种均低于1.0%
NA
NA
NA
CRF
CRF01 _AE
, 百拇医药
东南亚
4.7%
初始病毒载量可能较B型感染者高，但感染亚型可能是混杂的50
与B亚型相比，疾病进展可能加速36
NA
CRF02 _AG
西非
4.8%
体外复制率较B亚型高51
NA
NA
其他
, 百拇医药
各不相同
每种均 <0.1%
NA
NA
NA
* 定位及流行的数据来自Hemelaar等10。其他CRF包括CRF03至CRF34，这一类仍在不断扩充。CTL指细胞毒性T淋巴细胞，NA代表无可用数据。
表3 有关抗逆转录病毒治疗原发性耐药突变的部分研究详情*
研究
地区及年份
参试者数量
亚型或CRF的流行率
, http://www.100md.com
已知耐药突变的携带率
Nkengafac 等69
喀麦隆，2005–2006年
180
B亚型(42%)，G亚型 (29%)，其他(29%)
8%
Palma等70
葡萄牙，2003年
180
B 亚型(42%)，G 亚型(29%)，其他(29%)
8%
, http://www.100md.com
Tee等71
马来西亚，2003–2004年
100
CRF01_AE(65%)，AE/B(22%)，B亚型(12%)
1%
Paraskevis 等72
希腊，2002–2003年
101
B亚型(48%), A亚型(33%)
9%
Ly等73
, 百拇医药
柬埔寨，2003–2004年
144
CRF01_AE (97%)
5%
Descamps 等74
法国，2001–2002年
662
B 亚型(71%)，非B亚型 (29%)
发生在B亚型12%急性感染者和2%慢性感染者中，非B亚型感染者中较少
Wensing 等75
欧洲，1996–2002年
, http://www.100md.com
2208
B亚型 (70%)，C亚型 (10%)
在B亚型感染者中为13%，在非B
亚型感染者中为5%
Vazquez de Parga 等76
前苏联，1997–2004年
278
A 亚型(80%)
逆转录酶突变患者中的耐药率为13%，蛋白酶突变患者中的耐药率为 4%
Roudinskii 等77
, 百拇医药
前苏联，1995–2003年
119
A亚型 (97%)
未检测到
Grossman 等49
以色列，1999–2003年
117
C 亚型(75%)，B亚型 (25%)
C亚型感染者中的耐药率为50%，B亚型感染者中的耐药率为10%
Deshpande 等78
印度，2003年
, 百拇医药
128
C亚型 (96%)
<2%
Maljkovic 等79
瑞典，1998–2001年
100
B 亚型(55%)，C亚型 (29%)
9%
*这些研究是在2007年5月一次复习文献时选择的纳入至少100个分离株的研究。次要蛋白酶突变没有被计算在已知耐药突变的携带率中。CRF是指流行重组型。, 百拇医药
Barbara S. Taylor M.D.等
美国纽约哥伦比亚大学医学中心内科和感染病专业
详情请见《中国医学论坛报》
综述
医学进展
HIV-1亚型多样性带来的挑战(图3，表2、3)
图3 在各亚型HIV-1中，蛋白酶多态性引起的主要氨基酸(AA)变化
将HIV-1蛋白酶的AA序列与B亚型的一致序列进行比较。使用斯坦福HIV耐药数据库(http://hivdb.stanford.edu/pages/algs/HIVseq.html)的HIVseq程序，获得多态性数据。如果数据库中某位点310%序列呈多态性，则显示某已知亚型HIV-1蛋白酶AA10~99的多态性。色柱内显示多态性序列的百分率。检索表中显示的是亚型的名称，后面圆括号中标注的是分析中得出的多态性序列数。黑色方块表示主要蛋白酶耐药突变位点，白色方块表示次要蛋白酶耐药突变位点，资料来源为2007年国际艾滋病学会美国分会发布的信息。左侧显示每个位点的主要AA变化。HIV-1逆转录酶AA40~240的多态性见补充附录，该附录与本文全文见www.nejm.org.
, http://www.100md.com
表2. 各亚型或流行重组型(CRF)的HIV-1流行特征*
亚型或CRF
地区
全球流行率
趋向性和复制
疾病进展
对治疗的反应
亚型
A
东非、中非、中亚及东欧
12.3%
多数利用CCR5，即便是在晚期感染40
, 百拇医药
NA
与C亚型和D亚型相比无显著差异41
B
美洲、西欧、东亚及大洋洲
10.2%
早期利用CCR5，而感染晚期利用CXCR4增加28
HLA-B7与CTL反应差和病毒血症增加相关42，43，HLA-B57与病毒感染进展慢相关42，巴西的B型病毒株与感染进展慢相关44
NA
C
印度、东非及南非
49.9%
, 百拇医药
绝大多数利用CCR5，即便是晚期感染28；感染者阴道排毒增加30，母婴传播率升高29，45
HLA-B57与病毒感染进展慢相关42
与A亚型和D亚型相比无显著差异46，但产生耐药的机制不同41,47-49
D
东非
2.5%
感染早期即使用CXCR427
在乌干达、肯尼亚和坦桑尼亚的患者中，疾病进展较A型快37-39
NA
G
, 百拇医药
西非
6.3%
NA
NA
NA
F、H、 J和K
各不相同
每种均低于1.0%
NA
NA
NA
CRF
CRF01 _AE
, 百拇医药
东南亚
4.7%
初始病毒载量可能较B型感染者高，但感染亚型可能是混杂的50
与B亚型相比，疾病进展可能加速36
NA
CRF02 _AG
西非
4.8%
体外复制率较B亚型高51
NA
NA
其他
, 百拇医药
各不相同
每种均 <0.1%
NA
NA
NA
* 定位及流行的数据来自Hemelaar等10。其他CRF包括CRF03至CRF34，这一类仍在不断扩充。CTL指细胞毒性T淋巴细胞，NA代表无可用数据。
表3 有关抗逆转录病毒治疗原发性耐药突变的部分研究详情*
研究
地区及年份
参试者数量
亚型或CRF的流行率
, http://www.100md.com
已知耐药突变的携带率
Nkengafac 等69
喀麦隆，2005–2006年
180
B亚型(42%)，G亚型 (29%)，其他(29%)
8%
Palma等70
葡萄牙，2003年
180
B 亚型(42%)，G 亚型(29%)，其他(29%)
8%
, http://www.100md.com
Tee等71
马来西亚，2003–2004年
100
CRF01_AE(65%)，AE/B(22%)，B亚型(12%)
1%
Paraskevis 等72
希腊，2002–2003年
101
B亚型(48%), A亚型(33%)
9%
Ly等73
, 百拇医药
柬埔寨，2003–2004年
144
CRF01_AE (97%)
5%
Descamps 等74
法国，2001–2002年
662
B 亚型(71%)，非B亚型 (29%)
发生在B亚型12%急性感染者和2%慢性感染者中，非B亚型感染者中较少
Wensing 等75
欧洲，1996–2002年
, http://www.100md.com
2208
B亚型 (70%)，C亚型 (10%)
在B亚型感染者中为13%，在非B
亚型感染者中为5%
Vazquez de Parga 等76
前苏联，1997–2004年
278
A 亚型(80%)
逆转录酶突变患者中的耐药率为13%，蛋白酶突变患者中的耐药率为 4%
Roudinskii 等77
, 百拇医药
前苏联，1995–2003年
119
A亚型 (97%)
未检测到
Grossman 等49
以色列，1999–2003年
117
C 亚型(75%)，B亚型 (25%)
C亚型感染者中的耐药率为50%，B亚型感染者中的耐药率为10%
Deshpande 等78
印度，2003年
, 百拇医药
128
C亚型 (96%)
<2%
Maljkovic 等79
瑞典，1998–2001年
100
B 亚型(55%)，C亚型 (29%)
9%
*这些研究是在2007年5月一次复习文献时选择的纳入至少100个分离株的研究。次要蛋白酶突变没有被计算在已知耐药突变的携带率中。CRF是指流行重组型。, 百拇医药