李时珍遵从《内经》理论，认为三焦是有名有形的一腑，具有输出营卫、布散阳气、下渗水液的功能，又取《难经》之说，认为三焦相火发源于命门，成为三焦主持诸气的原动力——

    三焦乃六腑之一，始载《内经》。自《难经》创三焦有名无形之说后，遂为历代医家讨论的重要课题。明代医药学家李时珍著有《三焦客难》，阐明三焦，可惜已佚。从现存《本草纲目》《奇经八脉考》等书中，仍可窥见其对三焦所持的学术观点。深入探讨李时珍三焦理论，有助于更全面深入的认识三焦，对指导临床也有重大意义。

    三焦名实辨

    《灵枢·胀论》曰：“脏腑之在胸腹胁里之内也，若匣匮之藏禁器也。各有次舍，异名而同处。一域之中，其气各异。……故五脏六腑者各有畔界，其病各有形状。”说明脏腑在胸腹之内有如禁器深藏于匣匮之中，是各有形名的。三焦乃六脏之一。李时珍强调：“《灵枢·本脏论》已著其厚薄缓结之状”，应是有名有形的一腑。故他对于扁鹊《难经》“谓三焦有名无状”持异议，认为《难经》就是历代三焦无形缪说的原始，并指出：“高阳生伪撰《脉诀》，承其谬说，以误后人。至朱肱南阳《活人书》，陈言《三因方论》，戴起宗《脉诀刊误》，始著说辟之，而知之者尚鲜。”(《本草纲目·卷三十·胡桃》，下凡引此书文，只注卷数)朱肱等认为三焦有形，与其对《难经》及汉唐以来三焦有名无形说的批判意见一致，还原了《内经》三焦名实统一的基本理论。但“知之者尚鲜”，为此，李时珍特著《三焦客难》以阐明《内经》三焦本义。在李时珍的其他著作中，也可以体现他遵从《内经》三焦名实统一的学术观点。

    三焦之形实如何？李时珍原论不复得见。然根据他“约取《素问》之粹言”的说法，及以《内经》基本理论为准绳来研究医理、药理的一贯思想 ......