染色体3p12-14区域一个肺癌负相关新基因的初步鉴定
作者：曾平耀 田芳 陈主初 高志华 李友军 何春梅
单位：湖南医科大学肿瘤研究所， 湖南 长沙 410078
关键词：
中国病理生理杂志0010218
染色体3p的纯合性缺失(homozygous deletion, HD)和杂合性丢失(loss of heterozygosity, LOH)与包括肺癌、鼻咽癌等在内的多种人类实体肿瘤相关。3p12-14、3p21、3p25-26是肺癌中缺失频率最高的染色体位点。有研究证明，3p的缺失是肺癌变过程中最早发生的遗传学改变，发生在肺癌变过程的增生、间变期病变，提示染色体3p可能存在多个与肺癌癌变启动机制相关的抑瘤基因。目的和方法：为了鉴定、克隆人类染色体3p12-14区域与肺癌相关的新基因。我们利用生物信息学方法，通过对现有的生物信息数据库进行检索、分析，筛选定位于人类染色体3p12-14代表新基因的EST。应用差异RT-PCR和Northern blot分析，研究这些在肺癌细胞系和肺癌组织中的表达，鉴定与肺癌负相关的新基因EST；用cDNA末端快速扩增(RACE)技术分离肺癌相关新基因EST的全长cDNA序列。结果：在定位于染色体3p12-14的若干候选ESP中，鉴定了一个与肺癌呈负相关的EST，该EST在肺癌细胞系(HTB182， A549)中表达缺失，在非小细胞肺癌组织中表达缺失或降低达60%(9/15)。该基因cDNA全长为2.2 kb。序列分析表明，该基因与已克隆的基因无显著同源，表明其为肺癌相关的新基因，现将其初步命名为DEL1(deletion expression in lung cancer)。该基因的性质功能研究正在进行。, http://www.100md.com
单位：湖南医科大学肿瘤研究所， 湖南 长沙 410078
关键词：
中国病理生理杂志0010218
染色体3p的纯合性缺失(homozygous deletion, HD)和杂合性丢失(loss of heterozygosity, LOH)与包括肺癌、鼻咽癌等在内的多种人类实体肿瘤相关。3p12-14、3p21、3p25-26是肺癌中缺失频率最高的染色体位点。有研究证明，3p的缺失是肺癌变过程中最早发生的遗传学改变，发生在肺癌变过程的增生、间变期病变，提示染色体3p可能存在多个与肺癌癌变启动机制相关的抑瘤基因。目的和方法：为了鉴定、克隆人类染色体3p12-14区域与肺癌相关的新基因。我们利用生物信息学方法，通过对现有的生物信息数据库进行检索、分析，筛选定位于人类染色体3p12-14代表新基因的EST。应用差异RT-PCR和Northern blot分析，研究这些在肺癌细胞系和肺癌组织中的表达，鉴定与肺癌负相关的新基因EST；用cDNA末端快速扩增(RACE)技术分离肺癌相关新基因EST的全长cDNA序列。结果：在定位于染色体3p12-14的若干候选ESP中，鉴定了一个与肺癌呈负相关的EST，该EST在肺癌细胞系(HTB182， A549)中表达缺失，在非小细胞肺癌组织中表达缺失或降低达60%(9/15)。该基因cDNA全长为2.2 kb。序列分析表明，该基因与已克隆的基因无显著同源，表明其为肺癌相关的新基因，现将其初步命名为DEL1(deletion expression in lung cancer)。该基因的性质功能研究正在进行。, http://www.100md.com