Nih承诺资助全球化蛋白质数据库
http://www.100md.com
2002年9月22日
欧洲生物信息科学研究机构的目的是满足它的研究人员未来对蛋白质序列数据库的需要，如今美国正在积极行动起来帮助它实现这一目标。
据近期出版的《自然》杂志报道，美国国家卫生研究院(NIH)将在未来3年内提供1500万美元的经费帮助建立一个联合蛋白质数据库(United Protein UniPro)，即蛋白质序列和功能的全球化数据库。欧洲研究院将是这笔资助的主要接受者。
NIH计划于近期宣布，2/3的经费将用于帮助维护两个蛋白质数据库：Swiss-Prot和Trembl。Swiss-Prot是一个持续增长的蛋白质序列数据库，提供包括功能描述、结构和差异性在内的高水平注释。Trembl是一个由计算机注释的主要蛋白质数据库，它所收集的蛋白质序列还未合并到Swiss-Prot。这两个数据库分别是由位于英国剑桥附近的欧洲生物信息科学研究所(EBI)以及位于瑞士日内瓦、洛桑的瑞士生物信息科学研究所(SIB)的小组开发出来的。
NIH剩余的经费将用于支持位于美国的蛋白质信息资源数据库(PIR)，乔治亚大学医学中母涸鸶檬菘獾墓芾怼U庖皇菀步胨忧暗呐分薅允趾喜ⅰ?
EBI的Rolf Apweiler说：“这是NIH在美国之外资助的基础设施项目中最大的一笔经费，意义非凡。它表明美国已经意识到蛋白质序列数据的重心在欧洲。”
Swiss-Prot作为PIR数据库的补充版本创办于1986年。目前它已成长为世界最大的蛋白质序列数据库，一些研究人员说它所拥有的补充编辑和功能信息，以及与其它基因和生物信息数据库的丰富链接已经让它成为最有用的数据库。NIH的官员说，NIH支持Swiss-Prot是因为它认识到Swiss-Prot为通过全球化的努力和装备良好的数据库为生物学界提供了最好的服务，而不是又发展出一个对手。
在这一项目经费的资助下，PIR将不再维持它的数据库，但将辅助UniPro管理和输入数据。PIR所拥有的数据将合并入Trembl和Swiss-Prot。新经费让PIR保持现有的规模，但可资助EBI和SIB快速扩展其蛋白质生物信息项目。
对实验室的生物学家们来说，在蛋白质数据迅速膨胀的今天，这一举措将保证他们能获得稳定和可靠的蛋白质序列和功能数据资源。数据库的官员说，新的资助将会产生更高质量的编辑数据和更高级的数据导航工具。
但是有关NIH提供资助的新闻在欧洲也带来了一些政治麻烦，迫使极不情愿的欧盟委员会为生物信息基础设施提供经费。
欧洲的一位生物和信息学专家说：“美国为我们提供经费，而欧盟却似乎希望这些基础设施从天而降，这真是一个讽刺。”专家们指出，美国的投资不可避免地意味着美国在欧洲的生物信息基础设施方面有更大的发言权。, http://www.100md.com
据近期出版的《自然》杂志报道，美国国家卫生研究院(NIH)将在未来3年内提供1500万美元的经费帮助建立一个联合蛋白质数据库(United Protein UniPro)，即蛋白质序列和功能的全球化数据库。欧洲研究院将是这笔资助的主要接受者。
NIH计划于近期宣布，2/3的经费将用于帮助维护两个蛋白质数据库：Swiss-Prot和Trembl。Swiss-Prot是一个持续增长的蛋白质序列数据库，提供包括功能描述、结构和差异性在内的高水平注释。Trembl是一个由计算机注释的主要蛋白质数据库，它所收集的蛋白质序列还未合并到Swiss-Prot。这两个数据库分别是由位于英国剑桥附近的欧洲生物信息科学研究所(EBI)以及位于瑞士日内瓦、洛桑的瑞士生物信息科学研究所(SIB)的小组开发出来的。
NIH剩余的经费将用于支持位于美国的蛋白质信息资源数据库(PIR)，乔治亚大学医学中母涸鸶檬菘獾墓芾怼U庖皇菀步胨忧暗呐分薅允趾喜ⅰ?
EBI的Rolf Apweiler说：“这是NIH在美国之外资助的基础设施项目中最大的一笔经费，意义非凡。它表明美国已经意识到蛋白质序列数据的重心在欧洲。”
Swiss-Prot作为PIR数据库的补充版本创办于1986年。目前它已成长为世界最大的蛋白质序列数据库，一些研究人员说它所拥有的补充编辑和功能信息，以及与其它基因和生物信息数据库的丰富链接已经让它成为最有用的数据库。NIH的官员说，NIH支持Swiss-Prot是因为它认识到Swiss-Prot为通过全球化的努力和装备良好的数据库为生物学界提供了最好的服务，而不是又发展出一个对手。
在这一项目经费的资助下，PIR将不再维持它的数据库，但将辅助UniPro管理和输入数据。PIR所拥有的数据将合并入Trembl和Swiss-Prot。新经费让PIR保持现有的规模，但可资助EBI和SIB快速扩展其蛋白质生物信息项目。
对实验室的生物学家们来说，在蛋白质数据迅速膨胀的今天，这一举措将保证他们能获得稳定和可靠的蛋白质序列和功能数据资源。数据库的官员说，新的资助将会产生更高质量的编辑数据和更高级的数据导航工具。
但是有关NIH提供资助的新闻在欧洲也带来了一些政治麻烦，迫使极不情愿的欧盟委员会为生物信息基础设施提供经费。
欧洲的一位生物和信息学专家说：“美国为我们提供经费，而欧盟却似乎希望这些基础设施从天而降，这真是一个讽刺。”专家们指出，美国的投资不可避免地意味着美国在欧洲的生物信息基础设施方面有更大的发言权。, http://www.100md.com