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直肠柱下端之间借半月形的粘膜皱襞相连，这些半月形的粘膜皱襞称肛瓣，有6～12个。肛瓣是比较厚的角化上皮，当大便干燥时，肛瓣可受粪便硬块的损伤而撕裂。
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直肠柱与肛瓣围成的小隐窝称肛窦，又称肛隐窝，有6～12个。此窦开口向上，窦底有肛门腺的开口，深度一般0.3～0.5cm，窦内储存有粘液，有润滑
排便作用。由于该处常存有粪屑杂质，容易发生感染，引起隐窝炎，隐窝炎是继发肛周疾患的祸根。据统计，45%的人此窦较深大，17 %的人小而浅，7%的人无此窦。肛隐窝随着年龄的增长逐渐闭锁和消失。