中美联合研究表明：SARS病毒的进化分3个阶段
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2004年2月11日
据日本《经济新闻》报道，中美两国联合研究表明，引发严重急性呼吸综合症(SARS)的"SARS病毒"经过了3个阶段的进化。其中变异最快的是病毒传播的初期阶段。病毒在传播的中间阶段产生了"在人类之间传染的强感染性"、最终阶段则遴选出适合与人类共存的基因型(genotype)。此项研究成果刊登在《科学》(Science)杂志上。
SARS病毒是一种由大约3万个碱基构成的巨大RNA病毒。对复制酶(病毒复制敏)等非结构蛋白进行遗传编码的基因(ORF1a、1b)占整体的2/3，往下则排列着对S蛋白(Spike蛋白，病毒外侧突出的刺状结构)、envelope(外壳)、膜蛋白、病毒粒子(包含病毒RNA的蛋白)进行遗传编码的基因。
首次确认SARS病毒传播是2002年11月，在中国广东省发现了首例患者。在这个"初期阶段"，"人类之间的感染率"并不太高，只传染了3%左右的直接接触者。但是2003年1月在广东省的一家医院里则首次发生了大范围感染。2月，该医院一名访问香港的医生引发了香港地区的大范围感染。在这个"中间阶段"，直接接触者的感染率高得惊人，大约达到了70%，当时医学界就普遍认为SARS病毒可能产生了某种变异。
中国SARS分子流行病学机构和美国芝加哥大学组成的联合研究小组，对在病毒传播的各个阶段分离出来的63个SARS病毒碱基序列进行比较。追查了从疫情逐步扩大到疫情结束，到底产生了何种基因变异。
结果，通过对"病毒基因组(virus genome)长度"的分析发现，与中间阶段及最终阶段的SARS病毒相比，病毒基因组多出29个碱基的SARS病毒是传播初期阶段的主要病毒株之一(此外，此次还首次发现了少了82个碱基病毒株)。从果子狸发现的SARS疑似病毒也存在这些"多余的29个碱基"，因此研究人员进一步怀疑果子狸等感染的SARS疑似病毒可能就是SARS病毒的起源。
另外，通过对"碱基序列差异"的分析发现，S蛋白基因及其周围存在引发快速变异的"热点"。S蛋白是病毒吸附细胞的部位，目前可知SARS病毒有可能通过改变S蛋白而获得了在人类之间传染的能力。变异速度在初期阶段最为迅速，最终阶段仅产生了缓慢的变异。
综上所述，SARS病毒传播的进程是：来自果子狸等动物的SARS疑似病毒首先传染给人类，之后通过缺损29个碱基而使S蛋白发生变化，从而变异成了具有在人类之间传播的感染性和高致病性的SARS病毒。研究小组认为，虽然以S蛋白基因为主的碱基序列在此过程中发生了各种变化，但最终则可能逐渐变异成了适合与人类共存的一种主要病毒株(predominant genotype，主要基因型)。SARS是首个业已查明病毒"分子进化"如此迅速的传染病，此次的研究方法有望成为人类对付新型传染病的有力武器。
另外，论文最后提供了一些值得关注的最新信息。从去年12月中国发现的今冬首例SARS患者身上分离出来的SARS病毒S蛋白基因序列"比截至目前发现的任何SARS病毒都更接近于从果子狸分离出来的SARS疑似病毒"。此信息表明，并非重新感染了去年传播的SARS病毒，而是再次产生了新的SARS病毒，这种情况与流行性感冒病毒相同。但愿此类病毒不会进化成像去年那样具有强传染性和高致病性的病毒。, 百拇医药
SARS病毒是一种由大约3万个碱基构成的巨大RNA病毒。对复制酶(病毒复制敏)等非结构蛋白进行遗传编码的基因(ORF1a、1b)占整体的2/3，往下则排列着对S蛋白(Spike蛋白，病毒外侧突出的刺状结构)、envelope(外壳)、膜蛋白、病毒粒子(包含病毒RNA的蛋白)进行遗传编码的基因。
首次确认SARS病毒传播是2002年11月，在中国广东省发现了首例患者。在这个"初期阶段"，"人类之间的感染率"并不太高，只传染了3%左右的直接接触者。但是2003年1月在广东省的一家医院里则首次发生了大范围感染。2月，该医院一名访问香港的医生引发了香港地区的大范围感染。在这个"中间阶段"，直接接触者的感染率高得惊人，大约达到了70%，当时医学界就普遍认为SARS病毒可能产生了某种变异。
中国SARS分子流行病学机构和美国芝加哥大学组成的联合研究小组，对在病毒传播的各个阶段分离出来的63个SARS病毒碱基序列进行比较。追查了从疫情逐步扩大到疫情结束，到底产生了何种基因变异。
结果，通过对"病毒基因组(virus genome)长度"的分析发现，与中间阶段及最终阶段的SARS病毒相比，病毒基因组多出29个碱基的SARS病毒是传播初期阶段的主要病毒株之一(此外，此次还首次发现了少了82个碱基病毒株)。从果子狸发现的SARS疑似病毒也存在这些"多余的29个碱基"，因此研究人员进一步怀疑果子狸等感染的SARS疑似病毒可能就是SARS病毒的起源。
另外，通过对"碱基序列差异"的分析发现，S蛋白基因及其周围存在引发快速变异的"热点"。S蛋白是病毒吸附细胞的部位，目前可知SARS病毒有可能通过改变S蛋白而获得了在人类之间传染的能力。变异速度在初期阶段最为迅速，最终阶段仅产生了缓慢的变异。
综上所述，SARS病毒传播的进程是：来自果子狸等动物的SARS疑似病毒首先传染给人类，之后通过缺损29个碱基而使S蛋白发生变化，从而变异成了具有在人类之间传播的感染性和高致病性的SARS病毒。研究小组认为，虽然以S蛋白基因为主的碱基序列在此过程中发生了各种变化，但最终则可能逐渐变异成了适合与人类共存的一种主要病毒株(predominant genotype，主要基因型)。SARS是首个业已查明病毒"分子进化"如此迅速的传染病，此次的研究方法有望成为人类对付新型传染病的有力武器。
另外，论文最后提供了一些值得关注的最新信息。从去年12月中国发现的今冬首例SARS患者身上分离出来的SARS病毒S蛋白基因序列"比截至目前发现的任何SARS病毒都更接近于从果子狸分离出来的SARS疑似病毒"。此信息表明，并非重新感染了去年传播的SARS病毒，而是再次产生了新的SARS病毒，这种情况与流行性感冒病毒相同。但愿此类病毒不会进化成像去年那样具有强传染性和高致病性的病毒。, 百拇医药