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编号:10649655
中国人丙型肝炎病毒基因组3′端非编码区的研究
http://www.100md.com 《中华实验和临床病毒学杂志》 1999年第2期
丙型肝炎病毒|3′端非编码区|核苷酸序列|逆转录聚合酶链反应,关键词:
     兰水云 袁正宏 胡芸文 蒋伟伦 闻玉梅 200032 上海医科大学医学分子病毒学实验室(兰水云 袁正宏 闻玉梅),上海市传染病医院肝炎免疫室(胡芸文,蒋伟伦) 中华实验和临床病毒学杂志 1999 0 13 2


    关键词:丙型肝炎病毒;3′端非编码区;核苷酸序列;逆转录聚合酶链反应 期刊 zhsyhlcbdxzz 0 论著 fur -->


    

【摘要】 目的 分析中国丙型肝炎病人HCV基因组3′端非编码区(3′NCR),以促进对HCV基因组复制机制的研究。方法 采用两种方法,从上海地区感染HCV的病人血清中,扩增获得HCV基因组3′端非编码区:一是用套式PCR直接扩增,二是先分别获得HCV 3′NCR的前半部分和后半部分,再将两片段进行融合PCR。PCR产物进行测序后作同源性分析。在此基础上,建立了针对3′端非编码区的RT-PCR方法,并与基于5′端非编码区的RT-PCR方法检测HCV RNA的特异性和灵敏度比较。结果 序列分析表明,中国丙型肝炎病人HCV基因组3′非编码区由4部分组成:高度变异区、Poly(U)区、Poly(U/C)区和98碱基区。同源性分析显示,98碱基区在不同分离株间高度保守并与国外报道株一致,而Poly(U-UC)区存在较大差异。3′端非编码区和5′非编码区RT-PCR检测血清HCV RNA有较高符合率(95%)。结论 HCV基因组3′端非编码区的3′末端(98碱基),在不同分离株间的高度保守性提示,该区在HCV基因复制中起重要作用。基于3′非编码区的RT-PCR方法,将有助于HCV感染的诊断。

Study of the 3′noncoding region of Chinese hepatitis C virus genome LAN Shuiyun, YUAN Zhenghong, HU Yunwen, et al. Department of Molecular Virology, Shanghai Medical University, Shanghai 200032

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