关键词:丙型肝炎病毒;3′端非编码区;核苷酸序列;逆转录聚合酶链反应
【摘要】 目的 分析中国丙型肝炎病人HCV基因组3′端非编码区(3′NCR),以促进对HCV基因组复制机制的研究。方法 采用两种方法,从上海地区感染HCV的病人血清中,扩增获得HCV基因组3′端非编码区:一是用套式PCR直接扩增,二是先分别获得HCV 3′NCR的前半部分和后半部分,再将两片段进行融合PCR。PCR产物进行测序后作同源性分析。在此基础上,建立了针对3′端非编码区的RT-PCR方法,并与基于5′端非编码区的RT-PCR方法检测HCV RNA的特异性和灵敏度比较。结果 序列分析表明,中国丙型肝炎病人HCV基因组3′非编码区由4部分组成:高度变异区、Poly(U)区、Poly(U/C)区和98碱基区。同源性分析显示,98碱基区在不同分离株间高度保守并与国外报道株一致,而Poly(U-UC)区存在较大差异。3′端非编码区和5′非编码区RT-PCR检测血清HCV RNA有较高符合率(95%)。结论 HCV基因组3′端非编码区的3′末端(98碱基),在不同分离株间的高度保守性提示,该区在HCV基因复制中起重要作用。基于3′非编码区的RT-PCR方法,将有助于HCV感染的诊断。
Study of the 3′noncoding region of Chinese hepatitis C virus genome LAN Shuiyun, YUAN Zhenghong, HU Yunwen, et al. Department of Molecular Virology, Shanghai Medical University, Shanghai 200032
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