[摘 要] 目的: 研究SARS-CoV表面S蛋白由动物向人类跨种传播过程中的适应性进化过程。 方法: 用系统进化 树构建和群体遗传学方法，对100个S基因序列进行了分析。这些序列均从GenBank获得，并能反映整个SARS流行期。 结果: 依据系统进化树和流行病学资料，将SARS病毒分为三个流行群:02-04跨种传播群、03-早中期流行群和03-晚期流行群。它们分别代表SARS-CoV克服种间障碍实现跨种传播阶段、进入人类后的最初适应阶段以及在人类中建立感染后的阶段。在前两个流行群中，S蛋白受到了阳性选择压力，而在03晚期流行群中却遭受了很强的负选 择压力。三个流行群选择压力的比较显示，SARS-CoVs从动物向人类跨种传播过程中，S蛋白受到的阳性选择压力依次减小。 结论: 从最初的阳性选择到最后的负选择，S蛋白经历了变化的自然选择压力。这种变化的选择压力不仅反映了SARS-CoV由动物向人类跨种传播的适应性进化过程，也为研究其他病毒的跨种传播机制提供重要线索。

    [关键词] SARS-CoV; S蛋白; 适应性进化; 阳性选择; 跨种传播; 流行期

    Adaptive evolution of the Spike Gene of SARS Coronavirus during interspecies transmission from palm civet to human

    ZHANG Chi-yu ， WEI Ji-fu

    (1.Department of Biochemistry and Molecular Biology， School of Medical Technology， Jiangsu University ， Zhenjiang Jiangsu 212001; 2.Clinical Experimental Center， the First Affiliated Hospital of Nanjing Medical University， Nanjing Jiangsu 210029， China)

    [Abstract] Objective: To investigate the adaptive evolution of spike (S) protein in interspecies trans- mission of SARS-CoV from animals to human. Methods: A total of 100 S gene sequences were retrieved from the GenBank and analyzed using evolutionary bioinformatics methods. Results: According to phyloge- netic tree of S genes and epidemiological investigation ......