云南拉祜族六个基因座的遗传多态性研究
作者：邹苹 申滨 李德林 邹浪萍 褚嘉佑
单位：邹 苹(昆明市妇幼保健医院 昆明 650031)；申 滨 李德林(昆明医学院)；邹浪萍 (云南省高级人民法院司法鉴定科学技术研究所)；褚嘉佑(中国医学科学院生物医学研究所)
关键词：云南拉祜族；CSF1PO基因座；TPOX基因座；TH01基因座；F13A01基因座；FESFPS基因座；vWA基因座
川北医学院学报/990241提 要 目的：了解云南拉祜族6个短串联重复序列基因座遗传多态性分布。方法：应用复合扩增技术对CSF1PO、TPOX、TH01、F13A01、FESFPS和vWA等6个STR基因座进行分析，采用高分辨率的聚丙烯酰胺凝胶电泳分离、银染法显影技术，对云南拉祜族上述6个STR基因座进行遗传多态性调查。结果：CSF1PO基因座，观察到8个等位基因，20个基因型；TPOX基因座，观察到5个等位基因，14个基因型；TH01基因座，观察到6个等位基因，17个基因型；F13A01基因座，观察到6个等位基因，13个基因型；FESFPS基因座，观察到7个等位基因，15个基因型；vWA基因座，观察到7个等位基因，17个基因型。结论：上述6个短串联重复序列基因座基因频率分布与Hardy-Weinberg平衡吻合良好。
, 百拇医药
文章编号：1005-3697(1999)02-0056-03 中图分类号：R392.2 文献标识码：A
Distribution of Six STR Loci in Lahu Ethnic Group in China
Zou Ping et al
Maternity and Child-care Hospital of Kunning, Kunning,Yunnan,650031
ABSTRACT Objective This study was aimed for investigating the distribution of six STR loci in LaHu ethnic group. Methods: DNA extraction from blood and multiplex amplification of CSF1PO, TPOX, TH01, F13A01, FESFPS and vWA were carried out. Using denaturingpolyacrylamide gel electrophoresis and silver stain the distribution of allele frequencies of CSF1PO, TPOX, TH01, F13A01, FESFPSand vWA loci in LaHu ethnic group living in Yunnan province was investigated. Results：8 alleles and 20 genotypes of CSF1PO loci, 5 alleles and 14 genotypes of TPOX loci, 6 alleles and 17 genotypes of TH01 loci, 6 alleles and 13 genotypes of F13A01 loci, 7 alleles and 15 genotypes of FESFPS loci, 7 alleles and 17genotypes of vWA loci were observed. Conclusion:The allele distribution of the loci was in good agreement with the Hardy-weinberg equibrium.
, 百拇医药
Key Words LaHu ethnic group CSF1PO locus TPOX locus TH01 locus F13A01 locus FESFPS locus, vWA locus
短串联重复序列是由3至7个碱基对作为核心单位串联重复形成的一类DNA序列，由核心重复单位数目的变化构成了STR基因座的遗传多态性。在人类基因组中，每15Kb就有1个STR基因座，聚合酶链式反应分析时，STR等位基因片段大小一般为100-400bp。近年来STR-PCR技术有了明显的发展，解决了微量检材的分析问题，扩展了DNA分析在遗传学、人类学及法医学等领域中的应用。本研究是采用从血液中提取DNA，进行CSF1PO、TPOX和TH01及F13A01、FESFPS和vWA等6个基因座的复合扩增，应用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，银染法显色，对云南省拉祜族的上述6个基因座进行等位基因频率调查，获得了满意的结果，现报道如下：
1 材料与方法
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1.1 样本 152份血痕采自云南省红河地区的无血缘关系的拉祜族个体，在-20℃保存。
1.2 DNA提取及DNA测定按文献[1]进行。
1.3 PCR复合扩增。
1.3.1 六个基因座引物序列如下：
CSF1PO基因座为A：5′AACCTGAGTCTGCCAAGGACTAG
C3′;B:5′TTCCACACACCACTGGCCATCTTC3′。
TPOX基因座为A：5′GGTTGTAAGCTCCATGAGGTTAT
A3′;B:5′TTGAGCACTTACTATGTGCCAGGC3′。
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TH01基因座为A：5′GTGGGCTGAAAGCTCCCGATTA
T3′;B:5′ATTCAAAGGGTATCTGGGCTCTGG3′。
F13A01基因座为A：5′GAGGTTGCACTCGAGCCTTTGC
AA3′;B:5′TTCCTGAATCATCCCAGAGCCACA3′。
FESFPS基因座为A：5′GCTTGTTAATTCATGTAGGGAA
GGC3′;B:5′GTAGTCCCAGCTACTTGGCTACTC3′。
vWA基因座为A：5′TTGGAGTCGCAAGCTGAACTAG
CG3′;B:5′CCAGGAAGTTGAGGCTGTGAATCA3′。
, 百拇医药
1.3.2 PCR扩增体系及热循环条件 按文献[2、3]进行。
1.4 扩增产物分离 6 %聚丙烯酰胺凝胶(Acr∶Bis=19∶1)，含5 mol/L尿素制成31 cm×38 cm×0.4 mm胶板，0.5×TBE50 ℃下预电泳20 min,样品2 μl加上样缓冲液2 μl，上样前95 ℃2 min后置于冰上，与等位基因分型标准物同时40 mA电泳60 min。
1.5 银染显色 用10 %冰醋酸固定凝胶20 min,蒸馏水洗胶3次；用0.1 %硝酸银和0.1 %甲醛染色30 min,蒸馏水洗10 s，置于染色液(3 ml 37 %甲醛，60 mg碳酸钠加水2 L)中染色至清楚，照相或干胶保存。
1.6 统计学计算 对每个样品逐个分型并记录基因型，计算基因频率，按Nei公式计算期望杂合度，用Fisher公式计算个人识别机率。
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2 结果
从20 μl 血液中提取的样品DNA，用定量标准DNA同时电泳估计DNA含量，EB染色显示提取的样品DNA量高于4 ng/μl。本研究表明，CSF1PO，TPOX，TH01，F13A01，FESFPS和vWA6个基因座的复合扩增是灵敏的，一滴血就足够进行6个基因座复合扩增。本文进行的复合扩增方法简便，图谱清晰。
本次调查的拉祜族152份血痕均采自云南省红河地区的无血缘关系的拉祜族个体。调查获得了云南省拉祜族的CSF1PO，TPOX，TH01，F13A01，FESFPS和vWA6个基因座的扩增片段长度多态性的结果，见表2-4,其6个基因座的总个人识别率达0.9999，在法医学个人识别和亲子鉴定中有极为重要的作用。
CSF1PO，TPOX， TH01，F13A01，FESFPS和vWA是定位于5、2、11、6、15及12号不同染色体上的6个STR基因座，有关资料见表1。在欧美人群中有较好的多态性，而云南省是一个多民族的地区，进行少数民族的6个STR基因座遗传多态性分析，在人类学、法医学、民族学等领域有重要的应用价值。
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表1 6个基因座的有关资料 STR基因座
染色体定位
重复
系列
STR等位基因(bp)
HUMCSF1PO
5q33.3-34
AGAT
7(295)，8(299)，9(303)，10(307)，11(311)
12(315)，13(319)，14(323)，15(327)
HUMTPOX
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2p23-2pter
AATG
6(224)，7(228)，8(232)，9(236)
10(240)，11(244)，12(248)，13(252)
HUMTH01
11p15.5
AATG
5(179),6(183),7(187),8(191)
9(195)，9.3(198)，10(199)，11(203)
HUMF13A01
, 百拇医药
6p24-25
AAAG
4(283)，5(287)，6(291)，7(295)，8(299)
9(303)，10(307)，11(311)
HUMFESFPS
15q25-qter
AAAT
7(222)，8(226)，9(230)，10(234)，11(238)
12(242)，13(246)，14(250)
HUMvWFA31
, http://www.100md.com
12p-pter
ADAT
13(139)，14(143)，15(147)，16(151)
17(155)，18(159)，19(163)，20(167)
表2 云南拉祜族CSF1PO，TPOX和TH01三个基因座基因型分布 CSF1PO基因座
TPOX基因座
TH01基因座
基因型
观察数
期望值
, http://www.100md.com 基因型
观察数
期望值
基因型
观察数
期望值
7-12
1
0.59
8-8
34
33.63
6-6
, http://www.100md.com 1
0.73
8-11
1
0.58
8-9
12
11.28
6-7
6
6.50
8-13
1
, 百拇医药 0.16
8-10
5
5.18
6-8
2
2.70
9-9
1
0.53
8-11
52
52.21
, http://www.100md.com 6-9
9
8.85
9-10
4
3.55
8-12
6
7.05
6-9.3
2
1.31
9-11
, 百拇医药 5
5.21
9-9
1
0.95
7-7
15
14.53
9-12
6
6.45
9-10
1
, 百拇医药 0.87
7-8
12
12.06
9-13
1
1.42
9-11
8
8.76
7-9
41
39.58
, http://www.100md.com
10-10
6
5.92
9-12
1
1.18
7-9.3
5
5.87
10-11
17
17.37
10-11
, 百拇医药
4
4.02
8-8
3
2.50
10-12
23
21.31
10-12
1
0.54
8-9
16
, 百拇医药
16.42
10-13
4
4.17
11-11
21
20.26
8-9.3
2
2.44
11-11
12
12.47
, 百拇医药
11-12
5
5.47
8-10
1
0.39
11-12
34
31.55
12-12
1
0.37
9-9
, 百拇医药
26
26.95
11-13
6
6.94
0
0
9-9.3
8
8.00
11-14
1
0.58
, 百拇医药
0
0
0
9-10
2
1.27
12-12
18
19.45
0
0
0
9.3-9.3
, http://www.100md.com 1
0.59
12-13
8
8.60
0
0
0
0
0
0
12-14
1
0.72
, 百拇医药
0
0
0
0
0
0
13-13
2
0.95
0
0
0
0
0
, 百拇医药
0
合计
152
149.08
152
151.77
152
150.69
x2=7.8534 x2=1.8610 x2=2.6640 p>0.750p>0.990p>0.750
3 讨论
1989年，Litt,Luty,Tautz,Weber,Mary和候一平，等连续报道了STR基因座的应用[4、5]，STR基因座在人类学、法医学等领域不断显示出重要的应用价值。1991年，Edwards等[6]报道了STR多基因座的复合扩增。STR-PCR方法学上的改进，使其在各方面的应用更为广泛[4、7、8]，但用复合扩增进行STR多基因座少数民族的基因座报道不多，作者成功的用复合扩增技术进行STR多基因座云南省拉祜族的CSF1PO，TPOX，TH01，F13A01，FESFPS和vWA6个基因座的基因频率进行了调查，在人类学、法医学、民族学等领域有重要的应用价值。
, 百拇医药
表3 云南拉祜族F13A01，FESFPS和vWA三个基因座基因型分布 F13A01基因座
FESFPS基因座
vWA基因座
基因型
观察数
期望值
基因型
观察数
期望值
基因型
观察数
期望值
, 百拇医药
3.2-3.2
13
12.16
8-11
2
1.30
13-14
1
0.26
3.2-4
18
22.64
8-12
, 百拇医药
1
0.94
14-14
10
10.28
3.2-5
9
8.20
9-11
1
0.68
14-15
2
, http://www.100md.com
0.78
3.2-6
33
29.99
9-12
1
0.62
14-16
9
10.40
4-4
11
10.53
, 百拇医药
10-10
1
0.87
14-17
26
25.73
4-5
7
7.63
10-11
9
9.08
14-18
, 百拇医药
15
14.81
4-6
33
27.90
10-12
7
6.58
14-19
6
6.49
5-5
2
, 百拇医药
1.38
10-13
3
3.08
15-16
1
0.40
5-6
8
10.11
11-11
23
23.57
, http://www.100md.com
16-16
2
2.63
5-7
1
0.70
11-12
34
34.17
16-17
12
13.03
6-6
, 百拇医药
15
18.48
11-13
16
16.00
16-18
8
7.50
6-7
1
0.70
11-14
1
, 百拇医药
0.44
16-19
6
3.29
6-15
1
0.35
12-12
12
12.38
17-17
16
16.12
, http://www.100md.com
12-13
12
11.60
17-18
20
18.56
0
0
0
12-13
3
2.38
17-19
, http://www.100md.com
9
8.14
0
0
0
0
0
0
18-18
5
5.34
0
0
0
, 百拇医药
0
0
0
18-19
4
4.69
合计
152
150.77
152
150.31
148.45
x2=5.2330 x2=1.4671 x2=7.9772 p>0.500p>0.975p>0.500
, http://www.100md.com
笔者用从血液中提取的样品DNA 10 ng，做CSF1PO，TPOX，TH01及F13A01，FESFPS和vWA的复合扩增，结果152个样品均扩增成功。该研究表明CSF1PO，TPOX，TH01，F13A01，FESFPS和vWA6基因座的复合扩增是灵敏的，一滴血就足够进行6个基因座的复合扩增，这对大量人员遗传多态性的基因频率调查有重要的意义。
表4 云南拉祜族CFS1PO，TPOX，TH01，F13A01，FESFPS和vWA基因座的等位基因频率分布 CSF1PO
基因座
TPOX
基因座
TH01
基因座
, http://www.100md.com F13A01
基因座
FESFPS
基因座
vWA
基因座
7
0.0033
8
0.4704
6
0.0691
3.2
, http://www.100md.com
0.2381
8
0.0033
13
0.0033
8
0.0066
9
0.0789
7
0.3092
4
0.2063
, 百拇医药
9
0.0066
14
0.2599
9
0.0592
10
0.0362
8
0.1283
5
0.1310
10
, http://www.100md.com
0.0757
15
0.0099
10
0.1974
11
0.3651
9
0.4211
6
0.3929
11
0.4507
, http://www.100md.com
16
0.1316
11
0.2895
12
0.0493
9.3
0.0625
7
0.0238
12
0.3059
17
, http://www.100md.com
0.3259
12
0.3585
0
0
10
0.0099
15
0.0079
13
0.1480
18
0.1875
, 百拇医药
13
0.0789
0
0
0
0
0
0
14
0.0099
19
0.0822
14
, http://www.100md.com 0.0066
0
0
0
0
0
0
0
0
0
合计
1.000
0.9999
1.0001
, 百拇医药
1.0000
1.0001
1.0001
拉祜族是云南省特有的少数民族，本次调查的拉祜族是在云南省红河地区居住的少数民族。调查获得了云南省拉祜族的CSF1PO，TPOX，TH01，F13A01，FESFPS和vWA6个基因座的扩增片段长度多态性的结果，计算出该6个STR基因座的基因频率，经Hardy-Weinberg吻合度检验，观察数与期望值十分接近，符合平衡定律，CSF1PO基因座，杂合度为74.34 %，个人识别率是0.8840；TPOX基因座，杂合度为60.53%，个人识别率是0.7956；TH01基因座，杂合度为69.74 %，个人识别率是0.8594；F13A01基因座，杂合度为73.03 %，个人识别率是0.8607；FESFPS基因座，杂合度为68.42%，个人识别率是0.8429；vWA基因座，杂合度为78.29 %，个人识别率是0.9069，6个基因座的总个人识别率达0.9999，为用PCR技术达到个人认定创造了必要条件。
, 百拇医药
参考文献
1 邹浪萍、杨燕、褚嘉佑等.多重PCR检测CSF1PO，TPOXTH01基因座在中国汉族中的多态性，遗传学报，1998；25(3)：199～204
2 申滨、邹浪萍、褚嘉佑等.云南省景颇族三个STR位点遗传多态性分析.中华医学遗传学杂志，1998；15(1)：89～91
3 沈洪、邹苹、杨燕等.三个STR位点在傣族人群中的遗传多态性.中华医学遗传学杂志，1998；15(6)：357～359
4 Miller SA, Dykes DD, Polesky HF. Aysimple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nu cleic Acids Res, 1988,16(1):3～7
, http://www.100md.com
5 候一平、苟清、Michael Staat等.人类短串联重复序列HUMTH01基因座的遗传多态性.遗传学报，1996；23(3)：174～182
6 Edwards AT, Civitello A, Hammond HA, et al, DNA typing and genetic mapping with trimeric and tetrameric tandem repeats. Am J Hum Genet. 1991;50(5):746～751
7 Pures C.Identification of repeat sequence heterogeneity at the polymorphic STR locus HUMTH01(AATG)n and reassignment of alleles in population analysis using a locus-specific allelic ladder. Am J Hum Genet, 1993;50(6):953～961
8 Hammond HA, Li Jing, Zhong Y.Evaluation of 13 short tandem repeat loci for use in personal identification application. American Journal of Human Gentics, 1994;55(2):175～182
(收稿日期：1999-04-08), 百拇医药
单位：邹 苹(昆明市妇幼保健医院 昆明 650031)；申 滨 李德林(昆明医学院)；邹浪萍 (云南省高级人民法院司法鉴定科学技术研究所)；褚嘉佑(中国医学科学院生物医学研究所)
关键词：云南拉祜族；CSF1PO基因座；TPOX基因座；TH01基因座；F13A01基因座；FESFPS基因座；vWA基因座
川北医学院学报/990241提 要 目的：了解云南拉祜族6个短串联重复序列基因座遗传多态性分布。方法：应用复合扩增技术对CSF1PO、TPOX、TH01、F13A01、FESFPS和vWA等6个STR基因座进行分析，采用高分辨率的聚丙烯酰胺凝胶电泳分离、银染法显影技术，对云南拉祜族上述6个STR基因座进行遗传多态性调查。结果：CSF1PO基因座，观察到8个等位基因，20个基因型；TPOX基因座，观察到5个等位基因，14个基因型；TH01基因座，观察到6个等位基因，17个基因型；F13A01基因座，观察到6个等位基因，13个基因型；FESFPS基因座，观察到7个等位基因，15个基因型；vWA基因座，观察到7个等位基因，17个基因型。结论：上述6个短串联重复序列基因座基因频率分布与Hardy-Weinberg平衡吻合良好。
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文章编号：1005-3697(1999)02-0056-03 中图分类号：R392.2 文献标识码：A
Distribution of Six STR Loci in Lahu Ethnic Group in China
Zou Ping et al
Maternity and Child-care Hospital of Kunning, Kunning,Yunnan,650031
ABSTRACT Objective This study was aimed for investigating the distribution of six STR loci in LaHu ethnic group. Methods: DNA extraction from blood and multiplex amplification of CSF1PO, TPOX, TH01, F13A01, FESFPS and vWA were carried out. Using denaturingpolyacrylamide gel electrophoresis and silver stain the distribution of allele frequencies of CSF1PO, TPOX, TH01, F13A01, FESFPSand vWA loci in LaHu ethnic group living in Yunnan province was investigated. Results：8 alleles and 20 genotypes of CSF1PO loci, 5 alleles and 14 genotypes of TPOX loci, 6 alleles and 17 genotypes of TH01 loci, 6 alleles and 13 genotypes of F13A01 loci, 7 alleles and 15 genotypes of FESFPS loci, 7 alleles and 17genotypes of vWA loci were observed. Conclusion:The allele distribution of the loci was in good agreement with the Hardy-weinberg equibrium.
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Key Words LaHu ethnic group CSF1PO locus TPOX locus TH01 locus F13A01 locus FESFPS locus, vWA locus
短串联重复序列是由3至7个碱基对作为核心单位串联重复形成的一类DNA序列，由核心重复单位数目的变化构成了STR基因座的遗传多态性。在人类基因组中，每15Kb就有1个STR基因座，聚合酶链式反应分析时，STR等位基因片段大小一般为100-400bp。近年来STR-PCR技术有了明显的发展，解决了微量检材的分析问题，扩展了DNA分析在遗传学、人类学及法医学等领域中的应用。本研究是采用从血液中提取DNA，进行CSF1PO、TPOX和TH01及F13A01、FESFPS和vWA等6个基因座的复合扩增，应用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，银染法显色，对云南省拉祜族的上述6个基因座进行等位基因频率调查，获得了满意的结果，现报道如下：
1 材料与方法
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1.1 样本 152份血痕采自云南省红河地区的无血缘关系的拉祜族个体，在-20℃保存。
1.2 DNA提取及DNA测定按文献[1]进行。
1.3 PCR复合扩增。
1.3.1 六个基因座引物序列如下：
CSF1PO基因座为A：5′AACCTGAGTCTGCCAAGGACTAG
C3′;B:5′TTCCACACACCACTGGCCATCTTC3′。
TPOX基因座为A：5′GGTTGTAAGCTCCATGAGGTTAT
A3′;B:5′TTGAGCACTTACTATGTGCCAGGC3′。
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TH01基因座为A：5′GTGGGCTGAAAGCTCCCGATTA
T3′;B:5′ATTCAAAGGGTATCTGGGCTCTGG3′。
F13A01基因座为A：5′GAGGTTGCACTCGAGCCTTTGC
AA3′;B:5′TTCCTGAATCATCCCAGAGCCACA3′。
FESFPS基因座为A：5′GCTTGTTAATTCATGTAGGGAA
GGC3′;B:5′GTAGTCCCAGCTACTTGGCTACTC3′。
vWA基因座为A：5′TTGGAGTCGCAAGCTGAACTAG
CG3′;B:5′CCAGGAAGTTGAGGCTGTGAATCA3′。
, 百拇医药
1.3.2 PCR扩增体系及热循环条件 按文献[2、3]进行。
1.4 扩增产物分离 6 %聚丙烯酰胺凝胶(Acr∶Bis=19∶1)，含5 mol/L尿素制成31 cm×38 cm×0.4 mm胶板，0.5×TBE50 ℃下预电泳20 min,样品2 μl加上样缓冲液2 μl，上样前95 ℃2 min后置于冰上，与等位基因分型标准物同时40 mA电泳60 min。
1.5 银染显色 用10 %冰醋酸固定凝胶20 min,蒸馏水洗胶3次；用0.1 %硝酸银和0.1 %甲醛染色30 min,蒸馏水洗10 s，置于染色液(3 ml 37 %甲醛，60 mg碳酸钠加水2 L)中染色至清楚，照相或干胶保存。
1.6 统计学计算 对每个样品逐个分型并记录基因型，计算基因频率，按Nei公式计算期望杂合度，用Fisher公式计算个人识别机率。
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2 结果
从20 μl 血液中提取的样品DNA，用定量标准DNA同时电泳估计DNA含量，EB染色显示提取的样品DNA量高于4 ng/μl。本研究表明，CSF1PO，TPOX，TH01，F13A01，FESFPS和vWA6个基因座的复合扩增是灵敏的，一滴血就足够进行6个基因座复合扩增。本文进行的复合扩增方法简便，图谱清晰。
本次调查的拉祜族152份血痕均采自云南省红河地区的无血缘关系的拉祜族个体。调查获得了云南省拉祜族的CSF1PO，TPOX，TH01，F13A01，FESFPS和vWA6个基因座的扩增片段长度多态性的结果，见表2-4,其6个基因座的总个人识别率达0.9999，在法医学个人识别和亲子鉴定中有极为重要的作用。
CSF1PO，TPOX， TH01，F13A01，FESFPS和vWA是定位于5、2、11、6、15及12号不同染色体上的6个STR基因座，有关资料见表1。在欧美人群中有较好的多态性，而云南省是一个多民族的地区，进行少数民族的6个STR基因座遗传多态性分析，在人类学、法医学、民族学等领域有重要的应用价值。
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表1 6个基因座的有关资料 STR基因座
染色体定位
重复
系列
STR等位基因(bp)
HUMCSF1PO
5q33.3-34
AGAT
7(295)，8(299)，9(303)，10(307)，11(311)
12(315)，13(319)，14(323)，15(327)
HUMTPOX
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2p23-2pter
AATG
6(224)，7(228)，8(232)，9(236)
10(240)，11(244)，12(248)，13(252)
HUMTH01
11p15.5
AATG
5(179),6(183),7(187),8(191)
9(195)，9.3(198)，10(199)，11(203)
HUMF13A01
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6p24-25
AAAG
4(283)，5(287)，6(291)，7(295)，8(299)
9(303)，10(307)，11(311)
HUMFESFPS
15q25-qter
AAAT
7(222)，8(226)，9(230)，10(234)，11(238)
12(242)，13(246)，14(250)
HUMvWFA31
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12p-pter
ADAT
13(139)，14(143)，15(147)，16(151)
17(155)，18(159)，19(163)，20(167)
表2 云南拉祜族CSF1PO，TPOX和TH01三个基因座基因型分布 CSF1PO基因座
TPOX基因座
TH01基因座
基因型
观察数
期望值
, http://www.100md.com 基因型
观察数
期望值
基因型
观察数
期望值
7-12
1
0.59
8-8
34
33.63
6-6
, http://www.100md.com 1
0.73
8-11
1
0.58
8-9
12
11.28
6-7
6
6.50
8-13
1
, 百拇医药 0.16
8-10
5
5.18
6-8
2
2.70
9-9
1
0.53
8-11
52
52.21
, http://www.100md.com 6-9
9
8.85
9-10
4
3.55
8-12
6
7.05
6-9.3
2
1.31
9-11
, 百拇医药 5
5.21
9-9
1
0.95
7-7
15
14.53
9-12
6
6.45
9-10
1
, 百拇医药 0.87
7-8
12
12.06
9-13
1
1.42
9-11
8
8.76
7-9
41
39.58
, http://www.100md.com
10-10
6
5.92
9-12
1
1.18
7-9.3
5
5.87
10-11
17
17.37
10-11
, 百拇医药
4
4.02
8-8
3
2.50
10-12
23
21.31
10-12
1
0.54
8-9
16
, 百拇医药
16.42
10-13
4
4.17
11-11
21
20.26
8-9.3
2
2.44
11-11
12
12.47
, 百拇医药
11-12
5
5.47
8-10
1
0.39
11-12
34
31.55
12-12
1
0.37
9-9
, 百拇医药
26
26.95
11-13
6
6.94
0
0
9-9.3
8
8.00
11-14
1
0.58
, 百拇医药
0
0
0
9-10
2
1.27
12-12
18
19.45
0
0
0
9.3-9.3
, http://www.100md.com 1
0.59
12-13
8
8.60
0
0
0
0
0
0
12-14
1
0.72
, 百拇医药
0
0
0
0
0
0
13-13
2
0.95
0
0
0
0
0
, 百拇医药
0
合计
152
149.08
152
151.77
152
150.69
x2=7.8534 x2=1.8610 x2=2.6640 p>0.750p>0.990p>0.750
3 讨论
1989年，Litt,Luty,Tautz,Weber,Mary和候一平，等连续报道了STR基因座的应用[4、5]，STR基因座在人类学、法医学等领域不断显示出重要的应用价值。1991年，Edwards等[6]报道了STR多基因座的复合扩增。STR-PCR方法学上的改进，使其在各方面的应用更为广泛[4、7、8]，但用复合扩增进行STR多基因座少数民族的基因座报道不多，作者成功的用复合扩增技术进行STR多基因座云南省拉祜族的CSF1PO，TPOX，TH01，F13A01，FESFPS和vWA6个基因座的基因频率进行了调查，在人类学、法医学、民族学等领域有重要的应用价值。
, 百拇医药
表3 云南拉祜族F13A01，FESFPS和vWA三个基因座基因型分布 F13A01基因座
FESFPS基因座
vWA基因座
基因型
观察数
期望值
基因型
观察数
期望值
基因型
观察数
期望值
, 百拇医药
3.2-3.2
13
12.16
8-11
2
1.30
13-14
1
0.26
3.2-4
18
22.64
8-12
, 百拇医药
1
0.94
14-14
10
10.28
3.2-5
9
8.20
9-11
1
0.68
14-15
2
, http://www.100md.com
0.78
3.2-6
33
29.99
9-12
1
0.62
14-16
9
10.40
4-4
11
10.53
, 百拇医药
10-10
1
0.87
14-17
26
25.73
4-5
7
7.63
10-11
9
9.08
14-18
, 百拇医药
15
14.81
4-6
33
27.90
10-12
7
6.58
14-19
6
6.49
5-5
2
, 百拇医药
1.38
10-13
3
3.08
15-16
1
0.40
5-6
8
10.11
11-11
23
23.57
, http://www.100md.com
16-16
2
2.63
5-7
1
0.70
11-12
34
34.17
16-17
12
13.03
6-6
, 百拇医药
15
18.48
11-13
16
16.00
16-18
8
7.50
6-7
1
0.70
11-14
1
, 百拇医药
0.44
16-19
6
3.29
6-15
1
0.35
12-12
12
12.38
17-17
16
16.12
, http://www.100md.com
12-13
12
11.60
17-18
20
18.56
0
0
0
12-13
3
2.38
17-19
, http://www.100md.com
9
8.14
0
0
0
0
0
0
18-18
5
5.34
0
0
0
, 百拇医药
0
0
0
18-19
4
4.69
合计
152
150.77
152
150.31
148.45
x2=5.2330 x2=1.4671 x2=7.9772 p>0.500p>0.975p>0.500
, http://www.100md.com
笔者用从血液中提取的样品DNA 10 ng，做CSF1PO，TPOX，TH01及F13A01，FESFPS和vWA的复合扩增，结果152个样品均扩增成功。该研究表明CSF1PO，TPOX，TH01，F13A01，FESFPS和vWA6基因座的复合扩增是灵敏的，一滴血就足够进行6个基因座的复合扩增，这对大量人员遗传多态性的基因频率调查有重要的意义。
表4 云南拉祜族CFS1PO，TPOX，TH01，F13A01，FESFPS和vWA基因座的等位基因频率分布 CSF1PO
基因座
TPOX
基因座
TH01
基因座
, http://www.100md.com F13A01
基因座
FESFPS
基因座
vWA
基因座
7
0.0033
8
0.4704
6
0.0691
3.2
, http://www.100md.com
0.2381
8
0.0033
13
0.0033
8
0.0066
9
0.0789
7
0.3092
4
0.2063
, 百拇医药
9
0.0066
14
0.2599
9
0.0592
10
0.0362
8
0.1283
5
0.1310
10
, http://www.100md.com
0.0757
15
0.0099
10
0.1974
11
0.3651
9
0.4211
6
0.3929
11
0.4507
, http://www.100md.com
16
0.1316
11
0.2895
12
0.0493
9.3
0.0625
7
0.0238
12
0.3059
17
, http://www.100md.com
0.3259
12
0.3585
0
0
10
0.0099
15
0.0079
13
0.1480
18
0.1875
, 百拇医药
13
0.0789
0
0
0
0
0
0
14
0.0099
19
0.0822
14
, http://www.100md.com 0.0066
0
0
0
0
0
0
0
0
0
合计
1.000
0.9999
1.0001
, 百拇医药
1.0000
1.0001
1.0001
拉祜族是云南省特有的少数民族，本次调查的拉祜族是在云南省红河地区居住的少数民族。调查获得了云南省拉祜族的CSF1PO，TPOX，TH01，F13A01，FESFPS和vWA6个基因座的扩增片段长度多态性的结果，计算出该6个STR基因座的基因频率，经Hardy-Weinberg吻合度检验，观察数与期望值十分接近，符合平衡定律，CSF1PO基因座，杂合度为74.34 %，个人识别率是0.8840；TPOX基因座，杂合度为60.53%，个人识别率是0.7956；TH01基因座，杂合度为69.74 %，个人识别率是0.8594；F13A01基因座，杂合度为73.03 %，个人识别率是0.8607；FESFPS基因座，杂合度为68.42%，个人识别率是0.8429；vWA基因座，杂合度为78.29 %，个人识别率是0.9069，6个基因座的总个人识别率达0.9999，为用PCR技术达到个人认定创造了必要条件。
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参考文献
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(收稿日期：1999-04-08), 百拇医药