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编号:13156892
AFLP标记对灯盏花遗传多样性及选育品系群体一致性的分析(2)
http://www.100md.com 2013年7月15日 《中国中药杂志》 2013年第14期
     2.2.2 多态性分析

    2.2.3 聚类分析 根据按Nei和 Li[24]等的计算方法计算各品种间的遗传相似系数(genetic similarity,GS),GS在此表示AFLP谱带所显示的任意2个个体间基因组的相似程度,GS值愈小则变异愈大。2个个体间的遗传变异(genetic variability)即遗传多样性(genetic diversity),可以通过2个个体间基因组不同程度来体现。本文用遗传相似系数(GS)表示2个个体间基因组的相似程度。

    其中Nij 为材料i和 j共有的扩增片段数目,Ni 为材料i 中出现的扩增片段数目,Nj 为材料j中出现的扩增片段数目。

    所有的数据统计在Excel和生物学统计分析软件NTSYS2.10中进行。

    用生物学软件NTSYS2.10进行数据处理,计算遗传相似系数,使用SAHN程序进行聚类分析,用UPGMA(unweighted pair-group method with arithmetic mean,算数平均非加权配组法)生成树状聚类图 ......
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