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编号:12629839
铁皮石斛锌铁调控转运蛋白基因的克隆与表达分析(3)
http://www.100md.com 2015年1月1日 中国中药杂志 2015年第1期
     1.4生物信息学分析使用一系列网络在线工具进行DoZIP1基因及编码蛋白的生物信息学分析。利用NCBI的BLASTx(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/)和ORF Finder(http://www.ncbi.nlh.nih. gov/gorf/gorf.htmL)分析cDNA序列;用InterProScan(http://www.ebi.ac.uk/cgi-bin/iprscan/)和PROSITE SCAN(http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin/-npsa_ automat.pl?page=/NPSA/npsa_proscan.htmL)分析蛋白质结构域和基元;Protparam(http://web.expasy.org/protparam/)和SOPMA(http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin /secpred_sopma.pl)分析蛋白质理化性质和二级结构;ProtScale(http://web.expasy.org/protscale)分析蛋白的亲水性/疏水性;SignalP 4.0 (http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)预测信号肽;TMHMM(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)预测蛋白跨膜域 ......
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