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编号:12610074
红景天破壁饮片对小鼠肠道菌群影响的初步研究(3)
http://www.100md.com 2015年4月15日 中国中药杂志2015年第8期
     2.4 DGGE分析 参照Yang Wang等[2]的方法,应用DGGE电泳系统对PCR产物进行DGGE分析,具体条件为:聚丙烯酰胺浓度为8%,变性梯度为35%~65%,电泳条件是:电泳温度为60 ℃恒温,电压为85 V,电泳时间为16 h,电泳结束后用溴化乙锭(EB)进行染色,在紫外凝胶成像系统中成像,保存图谱。应用Quantity One 软件分析图谱,计算多样性指数(H)﹑物种丰度(S)﹑相似性系数(Cs)。

    多样性指数(H)计算公式为H=-∑(pi)×(lnpi),pi=ni/∑ni。其中ni表示DGGE图谱中某个样品单一条带的强度,∑ni代表该样品所有条带的总强度。物种丰度(S)为DGGE图谱中某个样品所有条带的数目。相似性系数(Cs)计算公式为:Cs=2Lab/(La+Lb)×100%,其中(La+Lb)为DGGE图谱中2个不同样品条带数之和 ......
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