基于受体药效团的CETP天然抑制剂的发现研究(1)

http://www.100md.com 2015年4月15日 中国中药杂志2015年第8期

     [摘要] 胆固醇酯转移蛋白(cholesterol ester transfer protein，CETP)是HDL的重要调控因子，抑制其活性可有效提高HDL的含量。由于HDL通过胆固醇逆向转运对动脉粥样硬化发挥的重要遏制作用，CETP已成为治疗心血管疾病的热门靶点。该文以PDB数据库中编号为4F2A的CETP蛋白结构为研究对象，对其活性区域内的药效特征进行识别、聚类及筛选，建立了基于CETP蛋白结构的受体药效团。最优药效团由6个疏水特征、1个氢键供体特征及9个排除体积组成，其辨识有效性指数N为3.33，综合评价指数CAI为2.31。同时，利用该模型对TCMD进行虚拟筛选，获得来源于315味中药的629个化合物。最后，该研究基于分子对接技术探讨了活性区域的关键氨基酸残基以及中药活性化合物与受体的相互作用 ......