不同种植年限黄连根系土壤细菌PCR—DGGE分析(1)

http://www.100md.com 2015年8月15日 《中国中药杂志》2015年第16期

     [摘要]该研究应用PCR-DGGE技术，分析了不同种植年限正常生长、发病的黄连Coptis chinensis的根际和非根际土壤的细菌种群多样性指数，并选取代表性DGGE条带进行克隆测序，构建细菌系统发育树状图。结果表明，正常土样与发病土样土壤细菌种群差异明显，且发病土样多样性指数(H)高于正常土样;代表性条带克隆测序结果表明，黄连种植土壤中未培养细菌为优势菌群，其余类群为食酸菌属、芽孢杆菌属、不动杆菌属、未培养克吕沃尔菌属以及未培养丛毛单胞菌，未发现已报道的植物病原细菌。发病土样中Clone band d的谱带亮度高于正常土样，该条带菌株在分类上属于食酸菌属。显然，黄连种植过程中，根际土壤中细菌种群发生了改变，其中食酸菌属的细菌在发病根际土壤增加，很可能与黄连病害发生有关。

    [关键词]黄连;细菌种群;根际土壤;16S rDNA;PCR-DGGE

    Bacteria community in different aged Coptis chinensis planting

    soil revealed by PCR-DGGE analysis

    TAN Yuan ......