基于ITS2序列SNP位点鉴定白及药材及其混伪品(3)
3.2 聚类分析 基于ITS2序列构建的白及药材及其混伪品物种的NJ树显示，同一物种的个体聚在一起形成独立的支系(BS支持率达85%以上)。聚类树中白及、黄花白及与小白及聚为一大支，其中，白及独立为一个分支;黄花白及与小白及聚为另一个分支，而黄花白及个体聚在一起形成独立的支系，NJ树能将这2个物种区分开(BS为88%)。华白及与竹叶兰聚为一大支，显示其与白及、黄花白及、小白及的亲缘关系相对较远;同时，华白及、竹叶兰的个体各自形成独立支系(BS为91%)，无交叉聚类现象存在，NJ树能将两者明显区分开。上述结果表明ITS2序列能够将这些物种区别开，即通过构建ITS2序列NJ树的方法能将白及属药用植物与其近缘混伪品物种进行鉴别，见图1。
3.3 SNP位点分析 序列经MEGA 5.0软件比对后，ITS2序列的长度为288 bp，保守位点166个，变异位点121个，简约信息位点109个。其中白及属内变异位点83个，简约信息位点76个;白及、黄花白及、小白及间的变异位点29个，简约信息位点22个;白及、黄花白及间简约信息位点22个;黄花白及、小白及间简约信息位点5个。从序列碱基变异的整体情况看，白及属内存在多个非编码区单核苷酸多态性。利用变异位点的多态性 ......
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3.3 SNP位点分析 序列经MEGA 5.0软件比对后，ITS2序列的长度为288 bp，保守位点166个，变异位点121个，简约信息位点109个。其中白及属内变异位点83个，简约信息位点76个;白及、黄花白及、小白及间的变异位点29个，简约信息位点22个;白及、黄花白及间简约信息位点22个;黄花白及、小白及间简约信息位点5个。从序列碱基变异的整体情况看，白及属内存在多个非编码区单核苷酸多态性。利用变异位点的多态性 ......
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