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编号:12762004
羌活不同地理种群ITS序列变异及系统发生分析(1)
http://www.100md.com 2015年10月1日 中国中药杂志2015年第19期
     [摘要]利用核糖体rRNA基因内转录间隔区(ITS)序列,对我国羌活31个野生群体的遗传结构进行了分析。经PCR扩增测序,获得长度为634~635 bp的ITS核苷酸序列,其平均G+C量(578%)显著高于A+T量。在羌活31个居群402条序列中共检测到31个变异位点,多态位点比例为488%,其中,简约信息位点为12个,共有31种单倍型。AMOVA分析结果显示:羌活大部分的遗传变异发生在居群间(57%)。以宽叶羌活为外群构建的NJ树显示:31个单倍型并没有按地理分布形成明显的族群,各地理单元中的单倍型相互混杂,没有明显的地理分化模式。

    [关键词]羌活;ITS;序列分析;遗传结构

    [Abstract]In this study, 31 Notopterygium incisum populations were analyzed using ITS sequences to investigate the genetic structure.The results showed that: the ITS region ranged in size from 634 to 635 bp and base composition was with high G+C content of 578% Thirtyone polymorphic sites were detected from 402 sequences of 31 populations of N incisum ......
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