黄芩葡萄糖醛酸水解酶基因的克隆、生物信息学分析及表达(3)

http://www.100md.com 2015年11月15日 《中国中药杂志》2015年第22期

     3.2理化性质分析利用ExPASyProteomicsServer的在线软件Protparam预测sbGUS基因编码蛋白的理化性质。sbGUS编码的蛋白由527个氨基酸组成(图2)，分子式为C₂₆₄₉HC₄₀₈₂N₆₈₆O₇₈₆S₁₉，总原子数为8222。相对分子质量为58.7248kDa，理论等电点pI5.55，带负电基(Asp+Glu)为61，带正电基(Arg+Lys)为49。不稳定指数为33.14，表明该蛋白不稳定。脂溶指数(aliphaticindex)为87.69。总平均亲水性(GRAVY)为-0.219，通常根据GRAVY在-2～2，正值表明此蛋白为疏水性蛋白，负值表明此蛋白为亲水性蛋白故sbGUS基因编码蛋白为亲水性蛋白。

    3.3sbGUS基因编码蛋白二级结构分析、结构域预测及三维建模蛋白质的空间结构决定了其功能作用，α-螺旋主要对蛋白质骨架起稳定作用，而无规则卷曲结构决定了蛋白质，尤其是酶的功能部位常常位于这种构象区域 ......