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编号:12835454
青海上北山林场野生桃儿七根部内生真菌群落组成及多样性研究(3)
http://www.100md.com 2016年4月1日 《中国中药杂志》2016年第7期
     22质量控制

    质量控制前共获得序列54 856条,质量控制后共获得优质序列22 565条,其中LD1,LD2,LD3分别为7 194,6 629,8 742条,全部序列长度均大于200 bp(=257 bp)。

    23OTU聚类及RDP分类

    质控后获得的序列,依据97%的序列相似性获得的可分类操作单元(OTUs)517个。其中样品LD1,LD2,LD3获得的OTUs数目分别为305,253,138个。RDP分类全部OTUs可划分为13纲,35目,44科,55属。样品LD1可划分为10纲,20目,26科,31属,LD2可被划分为11纲,22目,25科,31属,LD3可被划分为9纲,17目,21科,27属。

    24物种分布

    在门和属2个层次上对3个样品进行群落组成分析。除去未鉴定出的真菌外,3个样品均为子囊菌门和担子菌门2个门,其中LD1,LD2样品中子囊

    菌门占绝对优势分别为7608%,7294%,样品LD3中担子菌门占绝对优势为8039%。在属水平上进行分析,除去未鉴定出的真菌群落,所示样品中,见图2。排名前3的优势属真菌(所占比例之和超过全部的60%)LD1为Tetracladium ......
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