基于新疆紫草转录组的对羟基苯甲酸香叶基转移酶(PGT)
1材料
本研究所用的新疆紫草A euchroma PGT基因序列来源于实验室构建的转录组数据库。新疆紫草转录组测序样品取自细胞生长平顶期，采用Illumina HiSeq 2000测序，并使用SOAdenovo对转录组做从头组装。LePGT1，LePGT2，AePGT的信息来自NCBI数据库(http：//wwwncbinlmnihgov/)。
新疆紫草愈伤细胞红色高产系和白色低产系是由新疆紫草胚轴诱导并人工筛选获得，取自中国科学院植物研究所叶和春研究员处，并由本实验室保存并继代为悬浮细胞。
2方法
21新疆紫草PGT基因的获得
从NCBI蛋白数据库中查询得到紫草对羟基苯甲酸香叶基转移酶(PGT)序列LePGT1，LePGT2及新疆紫草中已报道的PGT序列AePGT，并分别以它们为query sequence，通过Blast软件在新疆紫草转录组数据库中搜寻同源序列 ......
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本研究所用的新疆紫草A euchroma PGT基因序列来源于实验室构建的转录组数据库。新疆紫草转录组测序样品取自细胞生长平顶期，采用Illumina HiSeq 2000测序，并使用SOAdenovo对转录组做从头组装。LePGT1，LePGT2，AePGT的信息来自NCBI数据库(http：//wwwncbinlmnihgov/)。
新疆紫草愈伤细胞红色高产系和白色低产系是由新疆紫草胚轴诱导并人工筛选获得，取自中国科学院植物研究所叶和春研究员处，并由本实验室保存并继代为悬浮细胞。
2方法
21新疆紫草PGT基因的获得
从NCBI蛋白数据库中查询得到紫草对羟基苯甲酸香叶基转移酶(PGT)序列LePGT1，LePGT2及新疆紫草中已报道的PGT序列AePGT，并分别以它们为query sequence，通过Blast软件在新疆紫草转录组数据库中搜寻同源序列 ......
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