基于分子模拟技术筛选LXRβ中药激动剂(1)
[摘要] 肝X受体β(liver X receptor β，LXRβ)与体内胆固醇代谢密切相关，是治疗高脂血症的药物新靶点。该文以LXRβ激动剂为载体，利用3DQSAR pharmacophore(Hypogen)模块构建定量药效团，得到最优的药效团模型包含1个氢键受体，1个芳环基团和2个疏水基团，药效团的5项评价指标分别为：训练集化合物的预测活性值和实验活性值的相关系数(correlation)为0.95、模型的费用函数(Δcost值)为128.65、活性化合物有效命中率(HRA)为84.44%、辨识有效性指数(IEI)为2.58、综合评价指数(CAI)为2.18。利用最优药效团模型筛选中药化学成分数据库(traditional Chinese medicine database，TCMD)，初步获得309个潜在的中药活性成分。随后利用Libdock分子对接方法进一步精制筛选结果，基于原配体的打分值以及关键氨基酸建立筛选规则，最终得到去甲氧基姜黄素、异甘草黄酮醇、胀果甘草查尔酮E、水飞蓟宁4个化合物为潜在的LXRβ激动剂。该研究可以高效、低耗的筛选潜在的LXRβ中药激动剂 ......
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