金钗石斛转录组中，SSR 的主要重复类型是单核苷酸，占SSR总数的7218%，二核苷酸和三核苷酸次之，分别为1597%，1119%，四、五、六核苷酸重复的数量极少，总计067%。从分布情况看，金钗石斛转录组中平均每3 748 bp 就含有1个SSR位点。但不同重复基序长度SSR分布的平均距离差距很大，其中单核苷酸重复最多，分布平均距离519 kb/SSR，五核苷酸重复最少，每条SSR分布平均距离7 66306 kb (表1)。

    李清等：金钗石斛转录组SSR位点信息分析表1金钗石斛转录组SSR不同重复基元分布情况

    金钗石斛转录组中共搜索到189种不同基序序列类型的SSR，单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复分别有4，12，60，77，16，20种类型。从出现频率来看(图2)，占绝对优势的重复基元类型是单核苷酸A/T，为总SSR 数目的7068%，其次是AG/CT和AT/AT，分别占总SSR数目的1104%，343%。在三核苷酸重复基元中以AAG/CTT数目最多，占总SSR 数目252%。其他四核苷酸、五核苷酸、六核苷酸重复基元类型分布较少 ......