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编号:13060486
基于超高效液相色谱飞行时间质谱技术的肺炎支原体感染小鼠血清代谢组学研究(3)
http://www.100md.com 2017年4月1日 《中国中药杂志》2017年第7期
     2.5 数据处理 将所有生物样本的UPLCMS数据导入MarKerview软件,进行峰匹配、峰对齐、峰提取和归一化处理,进而进行主成分分析(PCA)及正交偏最小二乘法判别分析(OPLSDA),并采用正交信号校正技术过滤变量信息,通过代谢轨迹变化趋势分析模型组与空白组的差异,确定主成分和潜在生物标志物(Marker)。利用QTOF测定各Marker的精确相对分子质量,对所筛查的具有显著性差异的代谢物进行分析,计算其可能的分子式。再通过分子式检索Human Metabolome Database(HMDB)数据库,结合文献和标准品确证的方式,鉴定潜在生物标志物的化学结构。通过检索代谢途径数据库KEGG和MetPA,结合相关文献、生物化学及分子生物学知识,探讨潜在生物标志物相关生物学意义。

    3 结果

    3.1 小鼠肺组织病理变化 小鼠肺组织病理切片评分系统由1 个0~26分的可数评分组成[8],5 个分类评价系统由管腔周围浸润而致的细支气管和支气管数目、管腔周围浸润的程度、管腔内渗出的严重度、血管周围浸润的频度、实质性肺炎的严重度合并后记分,每张切片选择5 个视野评分。空白组支气管、肺泡、血管等无明显病变 ......
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