研究表明，CKD患者出现肠道菌群失调的原因可能有以下几方面：一则，尿毒症患者血液中氨的高含量会直接导致结肠内条件致病菌数量增多、益生菌数量减少；二则，CKD患者的便秘并发症使得结肠转运时间延长，能降解蛋白质的条件致病菌数量就会在结肠中增多；三则，CKD患者食物结构的改变(高纤维摄入不足，富含钾的蔬菜和水果摄入过多等)会引起肠道内益生菌数量减少。此外，在CKD治疗过程中，抗生素的滥用和磷酸盐结合剂的使用也是肠道菌群失调的原因之一[35]。

    1.2 肠道菌群失调与肠源性尿毒素蓄积 对于肾功能减退的CKD患者，本来应该由肾脏排泄的尿毒素(uremic toxins)在体内蓄积必定会进一步加快肾功能减退。尿毒素依据其生化性质可分为3类：一是水溶性尿毒素，也就是不与蛋白质结合的小分子物质，如尿素氮(urea nitrogen)和肌酐(creatinine)；二是中分子尿毒素，如甲状旁腺素和β2微球蛋白(β2-microglobulin)；三是蛋白结合性尿毒素，如硫酸吲哚酚(indoxyl-sulfate)、对甲酚(p-cresol)以及三甲胺氧化物(trimethylamine-N-oxide，TMAO)等[36-38] ......