上海地区汉坦病毒基因分型和序列分析
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李燕婷 周妍 周欣 沈荣明 沈微娟 上海市疾病预防控制中心 上海市疾病预防控制中心 上海市疾病预防控制中心 上海市疾病预防控制中心 上海市疾病预防控制中心
【摘要】[目的 ]研究上海地区汉坦病毒基因型分布。 [方法 ]采用逆转录聚合酶链反应 (RT -PCR)、核苷酸测序法和系统发生树分析上海宿主动物中获得的 3 6株汉坦病毒M基因片段。 [结果 ]上海郊区汉坦病毒流行株有HTN型和SEO型 ,以HTN型为主 ;市区流行株为SEO型。核苷酸序列同源性及系统发生树分析表明上海地区HTN型汉坦病毒存在 3个不同分支 ,不同HTN型病毒间的核苷酸的差异在 6% -19%。 [结论 ]上海地区汉坦病毒以HTN型为主。可能存在汉坦病毒的不同基因亚型 ,对本市肾综合征出血热 (HFRS)的防治有重要指导意义
【关键词】 汉坦病毒 基因 序列分析
【分类号】R373.32
汉坦病毒(hantavirus.HV)感染人可以引起肾综合征出血热(HFRS) ,其病死率为2 %～10 %。上海市于2 0世纪6 0年代就有本病报道,每年均有病例发生。流行病学和血清学的资料表明,上海存在野鼠型(HTN)和家鼠型(SEO)两种汉坦病毒,但尚缺乏病毒的直接证据。为此采用分子生物技术对本
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摘要：[目的]研究上海地区汉坦病毒基因型分布。[方法]采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)、核苷酸测序法和系统发生树分析上海宿主动物中获得的36株汉坦病毒M基因片段。[结果]上海郊区汉坦病毒流行株有HTN型和SEO型,以HTN型为主；市区流行株为SEO型。核苷酸序列同源性及系统发生树分析表明上海地区HTN型汉坦病毒存在3个不同分支,不同HTN型病毒间的核苷酸的差异在6%-19%。[结论]上海地区汉坦病毒以HTN型为主。可能存在汉坦病毒的不同基因亚型,对本市肾综合征出血热(HFRS)的防治有重要指导意义。
关键词：汉坦病毒；基因；序列分析
中图分类号：R373.+2 文献标识码：A
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