基于网络药理学的补肾益心片治疗高血压分子机制研究(2)
1.1 药物化学成分和活性成分的获取
登录中药系统药理学数据库和分析平台(http：//lsp.nwu.edu.cn/，TCMSP)，分别以补肾益心片组成药物“淫羊藿”“车前子”为关键词检索，获得2种药物的化学成分信息，包括成分编号(Mol ID)、分子量(MW)、脂水分配系数(AlogP)、氢键供体(Hdon)、氢键受体(Hacc)、口服生物利用度(OB)、Caco-2渗透率、血脑屏障(BBB)、类药性(DL)、负分数可表达面积(FASA-)。考虑到中药成分纷繁复杂，必非所有成分均能进入体内发挥作用，选取同时满足OB>30%、DL>0.18的化学成分，作为其活性成分。
1.2 活性成分作用靶点获取
利用Discovery Studio 4.0对成分进行预处理，选择Minimize ligands模块，在CHARMm力场下采用共轭梯度法与最陡下降法相结合的能量优化算法，进行成分的能量最小化分析。然后采用BEST模式对分子进行多构象的生成。通过Chembiodraw Ultra 12.0軟件绘制出淫羊藿-车前子的活性成分3D结构图，以mol2格式保存。
将活性分子的3D结构上传到DRAR-CPI服务器(http：//cpi.bio-x.cn/drar/)，基于反向分子对接方法，对活性成分和蛋白相互作用的亲和性进行打分。按照服务器推荐，选定Z-score, 百拇医药(刘云娣 高佳珠 杨智华 麦喆钘 孙治中 李俊哲 温俊茂)
登录中药系统药理学数据库和分析平台(http：//lsp.nwu.edu.cn/，TCMSP)，分别以补肾益心片组成药物“淫羊藿”“车前子”为关键词检索，获得2种药物的化学成分信息，包括成分编号(Mol ID)、分子量(MW)、脂水分配系数(AlogP)、氢键供体(Hdon)、氢键受体(Hacc)、口服生物利用度(OB)、Caco-2渗透率、血脑屏障(BBB)、类药性(DL)、负分数可表达面积(FASA-)。考虑到中药成分纷繁复杂，必非所有成分均能进入体内发挥作用，选取同时满足OB>30%、DL>0.18的化学成分，作为其活性成分。
1.2 活性成分作用靶点获取
利用Discovery Studio 4.0对成分进行预处理，选择Minimize ligands模块，在CHARMm力场下采用共轭梯度法与最陡下降法相结合的能量优化算法，进行成分的能量最小化分析。然后采用BEST模式对分子进行多构象的生成。通过Chembiodraw Ultra 12.0軟件绘制出淫羊藿-车前子的活性成分3D结构图，以mol2格式保存。
将活性分子的3D结构上传到DRAR-CPI服务器(http：//cpi.bio-x.cn/drar/)，基于反向分子对接方法，对活性成分和蛋白相互作用的亲和性进行打分。按照服务器推荐，选定Z-score, 百拇医药(刘云娣 高佳珠 杨智华 麦喆钘 孙治中 李俊哲 温俊茂)