摘要：分子动力学模拟可以通过多款软件进行，根据需要不同可以选择不同的软件，但GROMACS是应用比较广泛的。生物大分子的结构动力学决定其生物学功能，而分子动力学模拟是研究其结构动力学的有效手段，因此采用GROMACS进行分子动力学计算分析从而指导进一步的实验工作。本文重点介绍了GROMACS的特点、基本流程以及制约因素等，并展望了未来的应用前景。

    关键词：分子动力学模拟；GROMACS；力场

    Abstract：Molecular dynamics simulation can be carried out through a variety of software， depending on the need to choose a different software， but GROMACS is widely used. biological functions of biological macromolecules is determined by its structural dynamics ......