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编号:13838157
医学生物学案例库构建及作用(3)
http://www.100md.com 2020年6月4日 《医学信息》 202022
     2.3 CardioTF数据库 CardioTF数据库是为了创建心血管基因调控的综合数据源,并促进对基因组数据的更深入了解。该数据库的目的是整理有关心血管转录因子(TF)、位置权重矩阵(PWM)和增强子序列的信息[9]。心脏病是婴儿和成人发病和死亡的主要原因之一[10,11]。由于需要对先天性心脏病(CHDs)病因进行深入研究,因而必须对心脏转录因子(TFs)突变进行鉴定[12]。另一方面,已经发现某些成人心脏病的发生是基因调控序列的变化所致[13]。因此,了解TF及其下游靶标以及参与心脏发育的调控基因组序列将增进我们对心脏病的了解。利用心脏TF来探明与心血管发育相关的所有转录信息是一种生物治疗项目,记录了跨物种的TF、PWM文件和增强子信息,包括苍蝇、海鞘、鱼、青蛙、鸡、小鼠和人类,并且CardioTF数据库具有一个即时搜索引擎来查询相关信息[9]。除了可以查询数据以外,使用Na?觙ve-Bayes方法来识别核心的心脏TF,可将其用作路线图,来进一步了解涉及心脏发育基因调控网络的增强子。心脏TFs先前被定义为心脏基因表达的调控因子,可以影响心脏的发育过程,特别是心肌的发育和维持。在CardioSignal数据库中,还对促进心肌细胞基因表达的心脏特异性增强子进行了比较 ......
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