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编号:37709
基于与铁死亡相关基因的肺腺癌的新型预后模型构建
http://www.100md.com 2021年8月11日 2021年第15期
肺癌,1资料与方法,2结果,3讨论
     张祥鑫,董星星,耿 涛,赵伯文,魏育涛

    (1.石河子大学医学院,新疆 石河子 832008;2.石河子大学医学院第一附属医院心胸外科,新疆 石河子 832008;3.济宁市第一人民医院,山东 济宁 272000)

    根据2020 年最新的GLOBALCAN 统计数据显示,全球186 个国家36 种癌症中乳腺癌发病率高居首位,但肺癌则是导致癌症死亡的首要原因。全球预计新增220 万肺癌病例,180 万例患者因肺癌而死亡[1]。肺腺癌是一种常见的非小细胞肺癌,约占非小细胞肺癌的50%[2]。虽然早期通过手术治疗的肺腺癌可以或得较长的生存期,但是总体的5 年生存率仅为18%[3]。铁死亡是一种Dixon 在2012 年发现的一种程序性细胞死亡,且有别于细胞的凋亡和坏死[4],铁死亡的发现促使人们对于肿瘤疾病的发生发展有了新的认识。目前研究发现,许多药物可以通过诱导肿瘤细胞铁死亡达到抑制肿瘤的增殖与转移的目的,因此铁死亡相关基因有希望成为未来治疗肿瘤的新靶点[5-7]。本研究基于TCGA 公共数据库中肺腺癌基因表达谱及临床相关数据进行联合分析,利用R 语言软件筛选出与铁死亡相关差异基因,利用单、多因素Cox 分析构建预后风险预测模型,并进一步评估了模型中基因与临床病理特征之间的相关性,并对其应用于肺腺癌的预后预测。

    1 资料与方法

    1.1 数据来源 本研究肺腺癌相关数据均通过TCGA(https://cancergenome.nih.gov)数据库公开获取。

    1.2 差异表达分析 根据GENCODE 项目(https://www.gencodegenes.org/)[8]中的基因注释,对肺腺癌患者相关RNA-seq 数据进行编码蛋白质的基因谱数据分类。运用R 语言中的“limma”[9]包对TCGA 数据库中的蛋白编码RNA-seq 数据进行分析,参照|logFC>1|及P<0.05 的筛选标准,获取肺腺癌组织和正常肺组织中的差异表达基因 ......

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