胰腺癌患者BZW1 和BZW2 表达水平及其与预后的相关性分析
生存期,数据库,1材料与方法,2结果,3讨论
漆处梅,唐小龙(1.达州市妇女儿童医院检验科,四川 达州 635000;2.滨州医学院第一临床医学院,山东 滨州 256600)
胰腺腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD),通常称为胰腺癌(pancreatic cancer,PC)。目前,胰腺癌仍然是最致命的癌症类型之一[1],预计其发病率会持续增加,到2030 年将成为癌症相关死亡的第2大常见原因[2]。由于诊断晚、转移早、对化疗或放疗反应有限,因此死亡率并未明显下降[3]。手术切除后的辅助化疗通常是治疗早期胰腺癌的首选方案,尽管化疗药物联合治疗可显著改善晚期胰腺癌患者的预后,但耐药的出现仍导致结局较差[3]。因此,胰腺癌新型预后标志物的再挖掘及鉴定是合理评估胰腺癌患者预后的关键点。为更加全面了解胰腺癌患者的预后状况,从而提高治疗效果,近年来在表达谱的广泛应用下,大量的基因组和转录组学数据得以积累,对其进行深度的挖掘和解读,无疑是推动医学发展的一项重要手段。由美国国家癌症研究所和美国人类基因组研究所共同开发的大型肿瘤研究项目-癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA),其利用高通量和多组学的肿瘤基因组分析技术,加深人类对肿瘤的认知,提高肿瘤的预防、诊断和治疗。基因型-组织表达(Genotype-Tissue Expression,GTEx)数据库包含了838 个捐赠者和17 382 个来自52 个组织和两个细胞系的样本,均为正常组织的测序结果。因此,联合GTEx 数据库分析可弥补TCGA 数据库中正常组织少的缺陷,从而提高差异分析结果的准确性。基本亮氨酸拉链和含W2 结构域的蛋白质1 和2(Basic leucine zipper and W2 domain-containing proteins 1 and 2,BZW1 和BZW2)在维持启动密码子选择的稳态严格性方面具有重要作用[4]。然而,有报道称[5,6],BZW1 和BZW2 的过表达与肺腺癌的不良预后有关。除此之外,BZW1 促进前列腺癌细胞的增殖及卵巢癌细胞迁移和侵袭[7,8]。BZW2 通过调控不同的信号通路可促进肝细胞癌和骨肉瘤等疾病的进展[9,10]。目前,尚未报道关于BZW1或BZW2 在胰腺癌中的作用,本研究通过整合生物信息学手段,构建分子蛋白网络并鉴定BZW1 和BZW2 涉及的生物学功能;其次,进一步利用TCGA和GTEx 数据库,鉴定BZW1 和BZW2 是否为胰腺癌患者潜在的预后标志物,以期为胰腺癌的发生发展调控机制提供一些科学依据。 ......
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