北京地区呼吸道合胞病毒分离株Ｆ蛋白基因序列分析

http://www.100md.com 2005年10月1日 芦 起 申昆玲 张 燕 刘亚谊 赵宇红 刘春艳 姬奕新 谢正

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     摘要：目的 分析中国北京地区4株呼吸道合胞病毒(RSV)F蛋白的基因序列并与RSV原型株A₂进行比较，得出中国北京地区RSVF蛋白基因是否存在变异及变异特征。方法 用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)分2段扩增F蛋白的基因核苷酸序列，将得到的P₁、P₂2段切胶纯化标记后测序，应用Bioedit软件对得到的序列做碱基配对和比较分析。结果 4株RSVF蛋白核苷酸序列的同源性为94.92%～95.62%。信号肽区的同源性为99.36%～99.73%。F1、F2亚单位同源性分别为98.93%～99.31%和96.69%～97.33%。氨基酸同源性分别为：F蛋白的蛋白编码区97.39%～97.74%，信号肽区99.13%～99.65%，F1、F2亚单位98.78%～99.48%、98.61%～99.30%。结论 中国RSV北京株与原型株A₂之间的F蛋白基因变异小，具有很高的同源性。氨基酸在抗原位点Ⅱ保守，此段氨基酸可作为RSV疫苗的候选位点。

    关键词：呼吸道合胞病毒；F蛋白；核苷酸序列

    中图分类号：R 725.6

    http://www.100md.com/html/paper/1006-7795/2005/05/13.htm

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