抗菌药的吸收、分布、代谢、排泄等药动学特点直接影响药物在感染部位的浓度高低、影响抗菌杀菌的持续时间和效能。大部分抗菌药在血供丰富的组织及尿、浆膜腔中的浓度可达有效水平，故这些部位的细菌感染易于控制。但在血供差的组织或有生理屏障的部位(如骨、脑脊液、前列腺、眼内等部位)，药物浓度则较低，影响抗感染的疗效。

    骨组织药物浓度

    克林霉素、林可霉素、磷霉素、环丙沙星、依诺沙星等在骨组织中浓度高，超过常见致病菌的抑菌浓度，因此金黄色葡萄球菌(对苯唑西林敏感)骨髓炎常选用克林霉素、林可霉素等治疗，而铜绿假单胞菌骨髓炎可选用环丙沙星等。

    中枢神经系统药物浓度

    氯霉素、磺胺药(SD、SMZ等)、甲氧苄胺(TMP)、甲硝唑、氧氟沙星、拉氧头孢、氟康唑、氟胞嘧啶、伏立康唑、异烟肼、利福平、吡嗪酰胺等容易透过血脑屏障 ......