RAPD条件优化及天麻基因组DNA多态性分析
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陶钧 罗志勇 刘水平 文李 陶垚 胡维新 中南大学生物科学与技术学院分子生物学研究所 中南大学生物科学与技术学院分子生物学研究所 中南大学生物科学与技术学院分子生物学研究所 长沙理工大学生物与轻工系 长沙理工大学生物与轻工系 中南大学生物科学与技术学院分子生物学研究所
【摘要】建立了RAPD扩增条件快速优化程序与方法,并应用于天麻基因组DNA扩增条件的优化及多态性的测定;获得了天麻基因组DNA的RAPD扩增优化条件和DNA指纹图谱;分析了模板DNA、引物、dNTP、TaqDNA聚合酶等的浓度和退火温度对RAPD扩增的影响.结果表明:天麻基因组DNA用引物S1扩增的片段具有更明显的多态性,这种指纹图谱更适合于天麻遗传分化研究;而用引物S12扩增的DNA指纹图谱具有更大的相似性,这种指纹图谱更适合于天麻真伪鉴别.该方法使RAPD扩增条件优化过程实现了程序化和数量化,是获得RAPD优化条件的简便快速、经济实用方法.应用该方法进行RAPD扩增,可获得图谱清晰、稳定可靠的实验结果.
【关键词】 RAPD 优化 天麻 DNA指纹图谱 DNA多态性
【基金】国家自然科学基金资助项目(30470189)
【分类号】S567.2
John G.K.W illiam s犤1犦等(1990)创立的随机扩增多态D N A(R A PD)技术可以在D N A序列信息未知的情况下,对物种基因组进行分析.因此,被广泛应用于研究动植物和微生物遗传多样性犤2,3犦、种间亲缘关系、品种鉴定犤4犦、品种系统分类犤5犦、遗传作图、基因定位、外源基因跟
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摘 要：建立了RAPD扩增条件快速优化程序与方法，并应用于天麻基因组DNA扩增条件的优化及多态性的测定：获得了天麻基因组DNA的RAPD扩增优化条件和DNA指纹图谱；分析了模板DNA、引物、dNTP、TaqDNA聚合酶等的农度和退火温度对RAPD扩增的影响.结果表明：天麻基因组DNA用引物S1扩增的片段具有更明显的多态性，这种指纹图谱更适合于天麻遗传分化研究；而用引物S12扩增的DNA指纹图谱具有更大的相似性。这种指纹图谱更适合于天麻真伪鉴别.该方法使RAPD扩增条件优化过程实现了程序化和数量化，是获得RAPD优化条件的简便快速、经济实用方法.应用该方法进行RAPD扩增，可获得图谱清晰、稳定可靠的实验结果.
关键词：RAPD；优化；天麻；DNA指纹图谱：DNA多态性
中图分类号：Q946
文献标识码：A
文章编号：1007—7847(2005)02—0150—06
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