丙酮醛诱导细胞凋亡相关基因SHMT2L的生物信息学分析
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曾军英 刘学伟 张杰 孙志洪 谭支良 中国科学院研究生院 云南大学 云南大学 中国科学院研究生院 中国科学院亚热带农业生态所
【摘要】基因芯片是一种高通量地同时研究多个基因表达的有力工具.在用基因芯片技术检测丙酮醛诱导人牙周膜成纤维细胞凋亡的基因表达研究中,发现一个新基因SHMT2L,其表达为显著下调,并推测该基因与细胞凋亡密切相关.利用生物信息学方法对SHMT2L基因及其蛋白产物进行各种分析,结果发现SHMT2L基因与线粒体丝氨酸羟甲基转移酶具有较高的相似性.SHMT2L在细胞中低表达与丙酮醛造成DNA损伤所引发的细胞凋亡相关.
【关键词】 丙酮醛 基因芯片 SHMTL 生物信息学
【基金】国家自然科学基金资助项目(30260027) 国家自然科学基金资助项目(30571352)
【分类号】R781.4
牙周病是人类常见的疾病之一,在我国人群中牙周病的发病率高达90%以上.近来Kashket等报道了丙酮醛(methylglyoxal,MG)在牙周病人牙周袋龈沟液的含量是正常人牙周袋龈沟液含量的15至20倍,此外还发现牙周致病菌福塞氏拟杆菌能代谢葡萄糖产生大量的MG[1].MG是一种有毒的代谢产物
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摘要：基因芯片是一种高通量地同时研究多个基因表达的有力工具。在用基因芯片技术检测丙酮醛诱导人牙周膜成纤维细胞凋亡的基因表达研究中，发现一个新基因SHMT2L，其表达为显著下调。并推测该基因与细胞凋亡密切相关。利用生物信息学方法对SHMT2L基因及其蛋白产物进行各种分析。结果发现SHMT2L基因与线粒体丝氨酸羟甲基转移酶具有较高的相似性。SHMT2L在细胞中低表达与丙酮醛造成DNA损伤所引发的细胞凋亡相关。
关键词：丙酮醛；基因芯片；SHMT2L；生物信息学
中图分类号：Q75
文献标识码：A
文章编号：1007-7847(2008)02-0131-05
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