农杆菌双组分信号转导系统中VirG蛋白结构与转化功能的分析
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严礼 夏立秋 丁学知 湖南师范大学生命科学学院微生物分子生物学湖南省重点实验室;
【摘要】农杆菌介导的转化方法在植物、真菌基因转化上有着重要意义,其中VirG蛋白起着重要作用.利用多种序列、结构分析对比软件,对根癌农杆菌和发根农杆菌4种代表性VirG蛋白基本性质、一级结构、二级结构、三级结构和表面静电势进行了预测比较和分析,发现N端差异较大.来自发根农杆菌的VirG蛋白更是在N端缺失了一段氨基酸,这可能是发根农杆菌转化效率低于根癌农杆菌的一个重要原因.结合文献关于定点突变的研究结果,经过总结分析VirG蛋白各位点突变对功能的影响,发现只有诸如N54和I77等少数位点的突变才对功能有促进作用.这些研究结果为提高农杆菌,尤其是发根农杆菌的侵染能力和范围提供了理论依据.
【关键词】 根癌农杆菌 发根农杆菌 VirG蛋白 结构 生物信息学
【基金】国家自然科学基金资助项目(30870064,30670052) 国家“863”计划资助项目(2006AA02Z187,2006AA10A212)
【分类号】Q93
农杆菌是一类在植物、真菌基因转化上使用非常广泛的革兰氏阴性土壤杆菌,主要有根癌农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)和发根农杆菌(Agrobacterium rhizogenes)两大类.农杆菌介导的转化方法(Agrobacterium tumefaciens-mediatedtransformation,ATMT)对于植物和真菌基因转化
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摘要：农杆菌介导的转化方法在植物、真菌基因转化上有着重要意义，其中VirC蛋白起着重要作用，利用多种序列、结构分析对比软件，对根癌农杆菌和发根农杆菌4种代表性VirG蛋白基本性质、一级结构、二级结构、三级结构和表面静电势进行了预测比较和分析，发现N端差异较大，来自发根农杆菌的VirG蛋白更是在N端缺失了一段氨基酸。这可能是发根农杆菌转化效率低于根癌农杆菌的一个重要原因，结合文献关于定点突变的研究结果。经过总结分析VirG蛋白各位点突变对功能的影响。发现只有诸如N54和T77等少数位点的突变才对功能有促进作用，这些研究结果为提高农杆菌，尤其是发根农杆菌的侵染能力和范围提供了理论依据。
关键词：根癌农杆菌；发根农杆菌；VirC蛋白；结构；生物信息学
中图分类号：Q71；Q93 文献标识码：A 文章编号：1007-7847(2008)04-0322-06
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