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编号:13392872
葛根素与水二聚体相互作用的密度泛函理论研究(2)
http://www.100md.com 2019年2月1日 《中国民族民间医药·下半月》 2019年第2期
     2 结果与讨论

    2.1 几何构型 图1和图2列出了优化后的葛根素和水分子的及原子编号,二聚体(Ⅰ~Ⅵ)的DFT-B3LYP/6-31+G全优化几何构型部分几何参数列于表1。其中酚羟基O25-H26(即葛根素异黄酮母核B环上的酚羟基)与水形成的二聚体称为二聚体Ⅰ;酚羟基O27-H28(即葛根素异黄酮母核A环羟基)与水形成的二聚体称为二聚体Ⅱ;羟基O44-H45与水形成的二聚体称为二聚体Ⅲ;羟基O34-H35与水形成的二聚体称为二聚体Ⅳ;羟基O36-H37与水形成的二聚体Ⅴ;羟基O41-H42(即葡萄糖五元环结构所连亚甲基上的羟基)于水形成的二聚体称为二聚体Ⅵ。

    由表1可见,二聚体(Ⅰ~Ⅵ)中的接触点(O-H…O)距离分别为0.1692、0.2589、0.1580、0.1606、0.1715和0.3094nm,长短次序为:Ⅲ<Ⅳ<Ⅰ<Ⅴ<Ⅱ<Ⅵ,接触点距离最短属于二聚体Ⅲ。二聚体(Ⅰ~Ⅵ)均近似地属于C1点群,与单体相比,二聚体(Ⅰ~Ⅵ)接触点为O-H…O的O-H键长变化分别为0.0018、0.0012、0.0027、0.0026、0.0017和0.0009nm ......
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