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编号:13811854
基于网络药理学探讨牛膝治疗膝骨性关节炎的有效物质与作用机制研究(3)
http://www.100md.com 2020年9月1日 《中国民族民间医药·下半月》 202009
     2.5 牛膝对KOA作用靶点的PPI网络构建结果 将获得牛膝作用于KOA的29个靶点基因上传至在线STRING 11.0数据库,选择物种为“Homo sapiens”(人类),设置靶点间最低要求互动得分为0.9并隐藏网络中断开连接的节点,获取相应的蛋白相互作用图如图3所示,根据Count值筛选列举牛膝治疗KOA排名前20的关键靶点结果如图4所示。

    2.6 牛膝治疗KOA的GO功能富集分析和 KEGG 通路富集分析结果 应用DAVID 6.8数据库对潜在效应靶点蛋白进行基因本体论(Gene Ontology, GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)通路富集分析。GO功能富集分析得出生物过程条目有1080条,细胞组成条目有8条,分子功能条目有36条,取每个部分排名前10的条目进行绘图、分析,不足10条的按实际富集信息展示,结果如图5所示。在生物过程分析中排名靠前的主要有细胞外基质、细胞外结构、神经炎症反应、对脂多糖的反应、急性期反应等;在细胞组成分析中排名靠前的主要有内质网腔、含胶原的细胞外基质、纤维状胶原三聚体、带状胶原纤维、胶原三聚体复合物等;在分子功能分析中排名靠前的主要有细胞因子活性、细胞因子受体结合、受体配体活性、整联蛋白结合、生长因子受体结合等 ......
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