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编号:248546
基于分子对接分析复方一枝黄花喷雾剂抗HIV-1蛋白酶和组织蛋白酶 L的研究
http://www.100md.com 2022年12月29日 中国民族民间医药 2022年第23期
氢键,1数据库及软件,2实验方法,3实验结果,4讨论
     朱海燕 庄田畋 杨 欣 危 英* 李 星 陈 梅 夏 文 周 英

    1.贵州中医药大学,贵州 贵阳 550025;2.贵州百灵制药股份有限责任公司,贵阳 安顺 550001

    复方一枝黄花喷雾剂由一枝黄花、贯众、山银花、连翘、荆芥、艾纳香、薄荷制成的喷雾剂[1]。由贵州百灵企业集团制药股份有限公司生产,主要功效为清热解毒,宣散风热,清利咽喉。用于上呼吸道感染,急、慢性咽炎,口舌生疮,牙龈肿痛,口臭[2]。已有文献[3-5]报道一枝黄花、山银花、贯众、连翘等中药具有抗病毒的作用。但是复方一枝黄花喷雾剂对HIV-1蛋白酶和Cathepsin L蛋白酶活性的影响尚未研究。目前,在药物研发的过程中,很多中药及复方的活性化合物的筛选依靠分子对接完成,优化的小分子与蛋白通过计算机模拟打分,快速有效地发现小分子活性成分[6]。分子对接技术已经应用到很多领域,得到的结果较为理想[7]。因此本研究采用药物分子设计模拟 SYBYL 2.1.1 软件的Surflex-Dock和模块完成复方一枝黄花喷雾剂药效物质与HIV-1蛋白酶和Cathepsin L蛋白酶的分子对接分析,为发现及开发抗病毒药物提供理论依据。

    1 数据库及软件

    中药系统药理学数据库和分析平台TCMSP(http://ibts.hkbu.edu.hk/LSP/.tcmspsearch);SwissADME(http://www.swissadme.ch/);蛋白质晶体结构数据库RCSB (http://www. rcsb. org/pdb );SYBYL 2.1.1(Tripos)处理器为Inter(R) Core(TM) i5-7500 CPU@3.4GHz,64位操作系统,软件已授权。

    2 实验方法

    2.1 复方一枝黄花喷雾剂活性成分筛选 通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)相关指标[8]:口服生物利用度(Oral Bioavailability,OB)、分子量(Molecular Weight ,MW)、类药性(Drug Likeness,DL)筛选丹参化学成分 ......

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