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编号:39337
基于IPTW法筛选高脂血症人群的差异肠道菌群
http://www.100md.com 2021年12月17日 2021年第11期
厚壁,杆菌属,菌门,1材料和方法,1临床样本及纳入标准,2粪便样本采集,DNA提取,3仪器与试剂,416SrDNA扩增与高通量测序,5数据处理和分析,6统计分析,2结果与分析,1组间临床信息与IPTW,2测序数据与
     陈姝琴,王兴欣,赵娟娟,纪泽敏,赵焕虎

    (民族医药教育部重点实验室 中央民族大学药学院 北京100081)

    高脂血症(Hyperlipidemia,HLP)是指人体内脂质代谢障碍导致体内血脂异常,从而严重危害人体健康的疾病。高脂血症可引起动脉粥样硬化,是心血管疾病的主要危险因素之一[1]。降低胆固醇的药物主要通过抑制细胞内胆固醇的合成,加速低密度脂蛋白胆固醇的分解或减少肠道内胆固醇的吸收,如他汀类药物,虽然这些药物疗效确切,但是具有肝功能受损等副作用[2-3]。

    人体内的微生物数量是人类细胞数的10 倍,其中肠道菌群的多样性由遗传和环境因素等共同决定[4]。肠道菌群通过产生代谢物影响宿主的代谢和健康,其中,主要通过短链脂肪酸、胆汁酸、氨基酸、内毒素等作用影响宿主的脂质代谢[5-7]。

    大多关于高脂血症的研究停留在实验室阶段,临床试验还很少。有研究通过16S rDNA 测序技术分析不同物质对高脂血症大鼠或小鼠肠道菌群的影响[8-12],而针对人的研究较少,具体的机制还需研究确认。

    本研究对高脂血症患者与非高脂血症人群的肠道菌群进行高通量测序分析,利用逆处理概率加权法(Inverse probability of treatment weighting,IPTW法)校正混杂因素,通过QIIME2 ANCOM 找出高脂血症患者与非高脂血症人群之间的差异肠道菌群,并通过R Tax4Fun 包进行功能预测。

    1 材料和方法

    1.1 临床样本及纳入标准

    本研究获得中央民族大学伦理委员会批准。132 例受试者样本均来自中央民族大学校医院参与慢性病体检和大肠癌筛查的教职工临床病例样本,均签署书面知情同意书。排除以下情况的人群:具有精神病史,滥用药物的人群;有手术或其它应急情况的人群;近期服用过抗生素或益生菌的人群(3 个月);长期服用类固醇激素、甲状腺激素、避孕药和影响血清脂质参数的药类。根据《中国成人血脂异常防治指南(2016年修订版)》相关标准,符合其中一项或多项诊断为高脂血症:1)总胆固醇>5.20 mmol/L;2)低密度脂蛋白胆固醇>3.4 mmol/L;3)甘油三酯>1.7 mmol/L;4)高密度脂蛋白胆固醇≤1.0 mmol/L[13-14]。

    1.2 粪便样本采集、DNA 提取

    采集受试者粪便样本,加入生理盐水,立即放在冰上进行分装、标记。每管样本300 mg,-80 ℃储存。根据强力土壤?DNA 提取试剂盒操作步骤提取DNA ......

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