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编号:383788
肠道真菌与消化系统疾病关系研究进展
http://www.100md.com 2017年1月11日 中华老年多器官疾病杂志 2017年第2期
念珠菌,菌群,1肠道真菌的检测方法,1传统方法,2分子生物学技术,2人类肠道真菌组成情况及影响因素,3肠道真菌与疾病,1肠道真菌与IBD,2肠道真菌与肝炎,3肠道真菌与AAD,4肠道真菌与消化道肿瘤,5肠道真菌与感染,4小结
     朱文华,吴本俨

    (解放军总医院南楼消化内科,北京 100853)

    人体消化道约定植 1012~1014个微生物,由细菌群、真菌群、病毒群、螺旋体群、古生菌群等组成[1]。肠道菌群与健康息息相关,肠道菌群紊乱会引发多种疾病,如腹泻、便秘、炎症性肠病、糖尿病、自闭症、肿瘤等[2]。目前已有大量的研究揭示肠道细菌菌群在人类健康及疾病中发挥着复杂的作用[3],而对肠道真菌菌群研究的广度和深度却远不及肠道细菌菌群。本文就肠道真菌菌群的检测方法、构成情况以及其在疾病中发挥的作用等进行综述。

    1 肠道真菌的检测方法

    1.1 传统方法

    依赖于培养的传统研究方法主要包括: 显微镜下观察、选择特定的培养基培养和生化鉴定。然而,由于大部分与人类相关的微生物均无法在实验室条件下培养出来,因此,依赖培养的传统研究方法就无法对整个肠道菌群的构成及动态变化情况进行研究[3]。

    1.2 分子生物学技术

    随着分子生物学技术应用于肠道菌群的检测,我们对肠道菌群有了更深入的了解。目前基于真菌18S rDNA及内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)的DNA测序被广泛应用于肠道真菌的检测。18S rDNA是真核生物核糖体小亚基rRNA的编码DNA,序列中既有保守区又有可变区:保守序列区域反映了生物物种间的亲缘关系; 而高变序列区域则能体现物种间的差异。18S rDNA适用于真菌菌种及以上的分类。ITS包括ITS1和ITS2:ITS1位于核糖体18S和5.8S rDNA之间;ITS2位于核糖体5.8S和28S rDNA之间。ITS的变异性比18S rDNA大,可以用来鉴定真菌菌种及亚种水平。将18S rDNA与ITS结合进行测序更加有利于真菌的分类研究[4-6]。但由于真菌在肠道中的丰度低、含量少,因此以通用引物扩增真菌DNA时也会出现阴性结果,这在某种程度上限制了肠道真菌的研究。而将培养法与测序法相结合会得到有关肠道真菌菌群的更多信息。

    2 人类肠道真菌组成情况及影响因素

    人类消化道及口腔共检出158个菌属和335个菌种,大都属于丝状真菌及酵母菌,主要由子囊菌门、担子菌门和接合菌门构成[7],并且受年龄、性别、饮食、种族、受检部位等的影响[4,8]。位于食管的优势真菌为念珠菌属;胃部存在念珠菌属和单胞瓶霉属真菌属;由于搜集小肠的样本比较困难,关于小肠的真菌分布情况研究很少,在小肠移植患者体内可发现酿酒酵母、克鲁弗酵母菌、念珠菌、新型隐球菌等;结肠及粪便的优势真菌菌群为念珠菌及酿酒酵母 ......

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